Protein–RNA interactions for Protein: P01906

HLA-DQA2, HLA class II histocompatibility antigen, DQ alpha 2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQA2P01906 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HLA-DQA2P01906 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HLA-DQA2P01906 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HLA-DQA2P01906 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HLA-DQA2P01906 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HLA-DQA2P01906 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HLA-DQA2P01906 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HLA-DQA2P01906 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HLA-DQA2P01906 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HLA-DQA2P01906 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HLA-DQA2P01906 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HLA-DQA2P01906 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HLA-DQA2P01906 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HLA-DQA2P01906 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HLA-DQA2P01906 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HLA-DQA2P01906 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HLA-DQA2P01906 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HLA-DQA2P01906 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HLA-DQA2P01906 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HLA-DQA2P01906 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HLA-DQA2P01906 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HLA-DQA2P01906 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HLA-DQA2P01906 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HLA-DQA2P01906 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HLA-DQA2P01906 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HLA-DQA2P01906 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HLA-DQA2P01906 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HLA-DQA2P01906 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HLA-DQA2P01906 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HLA-DQA2P01906 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HLA-DQA2P01906 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HLA-DQA2P01906 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HLA-DQA2P01906 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HLA-DQA2P01906 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HLA-DQA2P01906 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HLA-DQA2P01906 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HLA-DQA2P01906 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HLA-DQA2P01906 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HLA-DQA2P01906 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HLA-DQA2P01906 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HLA-DQA2P01906 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HLA-DQA2P01906 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HLA-DQA2P01906 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HLA-DQA2P01906 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HLA-DQA2P01906 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-DQA2P01906 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-DQA2P01906 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-DQA2P01906 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-DQA2P01906 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-DQA2P01906 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DQA2P01906 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DQA2P01906 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DQA2P01906 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DQA2P01906 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DQA2P01906 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DQA2P01906 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DQA2P01906 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DQA2P01906 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DQA2P01906 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DQA2P01906 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DQA2P01906 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DQA2P01906 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DQA2P01906 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DQA2P01906 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DQA2P01906 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DQA2P01906 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-DQA2P01906 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-DQA2P01906 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-DQA2P01906 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-DQA2P01906 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-DQA2P01906 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-DQA2P01906 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-DQA2P01906 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-DQA2P01906 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-DQA2P01906 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-DQA2P01906 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HLA-DQA2P01906 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HLA-DQA2P01906 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HLA-DQA2P01906 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-DQA2P01906 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-DQA2P01906 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-DQA2P01906 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-DQA2P01906 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-DQA2P01906 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-DQA2P01906 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-DQA2P01906 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-DQA2P01906 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-DQA2P01906 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-DQA2P01906 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-DQA2P01906 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-DQA2P01906 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-DQA2P01906 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-DQA2P01906 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-DQA2P01906 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-DQA2P01906 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-DQA2P01906 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DQA2P01906 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DQA2P01906 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DQA2P01906 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DQA2P01906 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms