Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GJB6O95452 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GJB6O95452 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GJB6O95452 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GJB6O95452 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GJB6O95452 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
GJB6O95452 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GJB6O95452 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GJB6O95452 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GJB6O95452 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GJB6O95452 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GJB6O95452 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GJB6O95452 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GJB6O95452 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
GJB6O95452 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GJB6O95452 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GJB6O95452 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GJB6O95452 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GJB6O95452 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GJB6O95452 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GJB6O95452 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GJB6O95452 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GJB6O95452 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GJB6O95452 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJB6O95452 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GJB6O95452 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GJB6O95452 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GJB6O95452 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GJB6O95452 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
GJB6O95452 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
GJB6O95452 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GJB6O95452 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GJB6O95452 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GJB6O95452 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GJB6O95452 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
GJB6O95452 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GJB6O95452 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GJB6O95452 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GJB6O95452 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GJB6O95452 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GJB6O95452 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GJB6O95452 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
GJB6O95452 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GJB6O95452 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GJB6O95452 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GJB6O95452 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GJB6O95452 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GJB6O95452 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GJB6O95452 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GJB6O95452 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GJB6O95452 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GJB6O95452 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GJB6O95452 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GJB6O95452 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GJB6O95452 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GJB6O95452 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GJB6O95452 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GJB6O95452 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GJB6O95452 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GJB6O95452 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GJB6O95452 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GJB6O95452 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GJB6O95452 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
GJB6O95452 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
GJB6O95452 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
GJB6O95452 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GJB6O95452 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GJB6O95452 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GJB6O95452 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GJB6O95452 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GJB6O95452 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GJB6O95452 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GJB6O95452 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GJB6O95452 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GJB6O95452 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GJB6O95452 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GJB6O95452 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GJB6O95452 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GJB6O95452 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
GJB6O95452 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GJB6O95452 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GJB6O95452 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GJB6O95452 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GJB6O95452 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GJB6O95452 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GJB6O95452 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GJB6O95452 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GJB6O95452 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GJB6O95452 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GJB6O95452 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GJB6O95452 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GJB6O95452 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GJB6O95452 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GJB6O95452 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GJB6O95452 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GJB6O95452 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GJB6O95452 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GJB6O95452 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GJB6O95452 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GJB6O95452 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.3 ms