Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRATO95237 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRATO95237 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRATO95237 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRATO95237 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRATO95237 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRATO95237 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRATO95237 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRATO95237 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRATO95237 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRATO95237 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRATO95237 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRATO95237 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRATO95237 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LRATO95237 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRATO95237 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRATO95237 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRATO95237 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LRATO95237 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRATO95237 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRATO95237 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRATO95237 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRATO95237 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRATO95237 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRATO95237 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LRATO95237 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRATO95237 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRATO95237 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRATO95237 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRATO95237 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRATO95237 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRATO95237 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LRATO95237 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LRATO95237 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRATO95237 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRATO95237 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRATO95237 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LRATO95237 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRATO95237 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRATO95237 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRATO95237 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRATO95237 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRATO95237 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRATO95237 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRATO95237 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRATO95237 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRATO95237 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRATO95237 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRATO95237 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRATO95237 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRATO95237 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRATO95237 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRATO95237 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LRATO95237 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRATO95237 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRATO95237 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRATO95237 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRATO95237 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRATO95237 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRATO95237 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRATO95237 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRATO95237 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRATO95237 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRATO95237 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRATO95237 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRATO95237 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRATO95237 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRATO95237 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRATO95237 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRATO95237 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRATO95237 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRATO95237 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRATO95237 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LRATO95237 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRATO95237 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRATO95237 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRATO95237 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRATO95237 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LRATO95237 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LRATO95237 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRATO95237 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRATO95237 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRATO95237 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRATO95237 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRATO95237 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRATO95237 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRATO95237 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRATO95237 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRATO95237 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRATO95237 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRATO95237 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRATO95237 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRATO95237 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRATO95237 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRATO95237 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRATO95237 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRATO95237 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRATO95237 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRATO95237 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRATO95237 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms