Protein–RNA interactions for Protein: O94913

PCF11, Pre-mRNA cleavage complex 2 protein Pcf11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCF11O94913 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
PCF11O94913 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
PCF11O94913 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC41.26■■■■■ 4.2
PCF11O94913 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
PCF11O94913 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
PCF11O94913 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.25■■■■■ 4.19
PCF11O94913 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC41.24■■■■■ 4.19
PCF11O94913 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
PCF11O94913 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.23■■■■■ 4.19
PCF11O94913 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
PCF11O94913 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
PCF11O94913 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
PCF11O94913 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.21■■■■■ 4.19
PCF11O94913 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC41.21■■■■■ 4.19
PCF11O94913 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC41.2■■■■■ 4.19
PCF11O94913 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
PCF11O94913 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
PCF11O94913 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
PCF11O94913 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC41.16■■■■■ 4.18
PCF11O94913 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC41.16■■■■■ 4.18
PCF11O94913 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
PCF11O94913 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
PCF11O94913 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
PCF11O94913 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC41.13■■■■■ 4.18
PCF11O94913 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
PCF11O94913 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC41.12■■■■■ 4.17
PCF11O94913 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC41.12■■■■■ 4.17
PCF11O94913 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.12■■■■■ 4.17
PCF11O94913 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC41.11■■■■■ 4.17
PCF11O94913 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
PCF11O94913 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC41.09■■■■■ 4.17
PCF11O94913 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.08■■■■■ 4.17
PCF11O94913 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.07■■■■■ 4.17
PCF11O94913 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC41.06■■■■■ 4.16
PCF11O94913 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC41.06■■■■■ 4.16
PCF11O94913 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
PCF11O94913 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.05■■■■■ 4.16
PCF11O94913 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC41.03■■■■■ 4.16
PCF11O94913 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC41.03■■■■■ 4.16
PCF11O94913 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
PCF11O94913 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC41.02■■■■■ 4.16
PCF11O94913 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
PCF11O94913 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
PCF11O94913 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC41.02■■■■■ 4.16
PCF11O94913 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.02■■■■■ 4.16
PCF11O94913 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
PCF11O94913 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC41.01■■■■■ 4.16
PCF11O94913 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC41.01■■■■■ 4.15
PCF11O94913 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC41.01■■■■■ 4.15
PCF11O94913 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC41.01■■■■■ 4.15
PCF11O94913 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
PCF11O94913 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC41■■■■■ 4.15
PCF11O94913 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC40.99■■■■■ 4.15
PCF11O94913 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
PCF11O94913 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC40.98■■■■■ 4.15
PCF11O94913 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC40.98■■■■■ 4.15
PCF11O94913 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
PCF11O94913 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
PCF11O94913 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC40.97■■■■■ 4.15
PCF11O94913 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.97■■■■■ 4.15
PCF11O94913 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
PCF11O94913 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
PCF11O94913 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
PCF11O94913 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
PCF11O94913 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.92■■■■■ 4.14
PCF11O94913 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC40.92■■■■■ 4.14
PCF11O94913 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
PCF11O94913 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
PCF11O94913 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
PCF11O94913 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC40.89■■■■■ 4.14
PCF11O94913 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
PCF11O94913 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
PCF11O94913 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
PCF11O94913 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
PCF11O94913 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
PCF11O94913 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
PCF11O94913 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC40.85■■■■■ 4.13
PCF11O94913 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
PCF11O94913 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
PCF11O94913 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
PCF11O94913 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
PCF11O94913 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
PCF11O94913 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
PCF11O94913 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
PCF11O94913 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC40.83■■■■■ 4.13
PCF11O94913 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC40.82■■■■■ 4.13
PCF11O94913 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
PCF11O94913 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
PCF11O94913 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
PCF11O94913 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
PCF11O94913 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC40.81■■■■■ 4.12
PCF11O94913 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC40.81■■■■■ 4.12
PCF11O94913 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
PCF11O94913 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC40.8■■■■■ 4.12
PCF11O94913 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
PCF11O94913 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.79■■■■■ 4.12
PCF11O94913 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.78■■■■■ 4.12
PCF11O94913 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC40.78■■■■■ 4.12
PCF11O94913 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC40.76■■■■■ 4.12
PCF11O94913 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.76■■■■■ 4.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms