Protein–RNA interactions for Protein: O75865

TRAPPC6A, Trafficking protein particle complex subunit 6A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6AO75865 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC6AO75865 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC6AO75865 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC6AO75865 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC6AO75865 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC6AO75865 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC6AO75865 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC6AO75865 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC6AO75865 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC6AO75865 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC6AO75865 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC6AO75865 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC6AO75865 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC6AO75865 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC6AO75865 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC6AO75865 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
TRAPPC6AO75865 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC6AO75865 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC6AO75865 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC6AO75865 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC6AO75865 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC6AO75865 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC6AO75865 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC6AO75865 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC6AO75865 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC6AO75865 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC6AO75865 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC6AO75865 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC6AO75865 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC6AO75865 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC6AO75865 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC6AO75865 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC6AO75865 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC6AO75865 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC6AO75865 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC6AO75865 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC6AO75865 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC6AO75865 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC6AO75865 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC6AO75865 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC6AO75865 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC6AO75865 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC6AO75865 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC6AO75865 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC6AO75865 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC6AO75865 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC6AO75865 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC6AO75865 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC6AO75865 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC6AO75865 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC6AO75865 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC6AO75865 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC6AO75865 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC6AO75865 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC6AO75865 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC6AO75865 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC6AO75865 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC6AO75865 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC6AO75865 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC6AO75865 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC6AO75865 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC6AO75865 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC6AO75865 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC6AO75865 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC6AO75865 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC6AO75865 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC6AO75865 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC6AO75865 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC6AO75865 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC6AO75865 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC6AO75865 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC6AO75865 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC6AO75865 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC6AO75865 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC6AO75865 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC6AO75865 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC6AO75865 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC6AO75865 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC6AO75865 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC6AO75865 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC6AO75865 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC6AO75865 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC6AO75865 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC6AO75865 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC6AO75865 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC6AO75865 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC6AO75865 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC6AO75865 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC6AO75865 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC6AO75865 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC6AO75865 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC6AO75865 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC6AO75865 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC6AO75865 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC6AO75865 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC6AO75865 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC6AO75865 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRAPPC6AO75865 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC6AO75865 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC6AO75865 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms