Protein–RNA interactions for Protein: O75677

RFPL1, Ret finger protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL1O75677 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RFPL1O75677 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RFPL1O75677 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RFPL1O75677 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RFPL1O75677 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RFPL1O75677 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RFPL1O75677 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RFPL1O75677 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RFPL1O75677 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RFPL1O75677 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RFPL1O75677 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RFPL1O75677 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RFPL1O75677 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RFPL1O75677 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RFPL1O75677 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RFPL1O75677 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RFPL1O75677 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RFPL1O75677 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RFPL1O75677 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RFPL1O75677 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RFPL1O75677 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RFPL1O75677 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RFPL1O75677 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RFPL1O75677 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RFPL1O75677 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RFPL1O75677 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RFPL1O75677 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RFPL1O75677 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RFPL1O75677 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RFPL1O75677 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RFPL1O75677 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RFPL1O75677 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RFPL1O75677 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RFPL1O75677 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RFPL1O75677 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RFPL1O75677 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RFPL1O75677 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RFPL1O75677 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RFPL1O75677 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RFPL1O75677 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFPL1O75677 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFPL1O75677 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFPL1O75677 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFPL1O75677 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFPL1O75677 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFPL1O75677 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RFPL1O75677 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RFPL1O75677 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RFPL1O75677 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RFPL1O75677 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RFPL1O75677 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RFPL1O75677 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RFPL1O75677 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RFPL1O75677 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RFPL1O75677 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RFPL1O75677 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RFPL1O75677 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RFPL1O75677 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RFPL1O75677 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RFPL1O75677 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RFPL1O75677 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RFPL1O75677 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RFPL1O75677 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RFPL1O75677 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RFPL1O75677 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RFPL1O75677 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RFPL1O75677 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RFPL1O75677 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RFPL1O75677 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RFPL1O75677 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RFPL1O75677 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RFPL1O75677 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RFPL1O75677 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RFPL1O75677 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RFPL1O75677 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RFPL1O75677 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RFPL1O75677 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RFPL1O75677 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RFPL1O75677 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RFPL1O75677 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RFPL1O75677 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RFPL1O75677 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RFPL1O75677 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RFPL1O75677 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RFPL1O75677 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RFPL1O75677 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RFPL1O75677 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RFPL1O75677 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RFPL1O75677 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RFPL1O75677 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RFPL1O75677 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RFPL1O75677 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RFPL1O75677 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RFPL1O75677 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RFPL1O75677 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RFPL1O75677 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RFPL1O75677 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RFPL1O75677 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RFPL1O75677 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RFPL1O75677 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms