Protein–RNA interactions for Protein: O60245

PCDH7, Protocadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH7O60245 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDH7O60245 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDH7O60245 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDH7O60245 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDH7O60245 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDH7O60245 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDH7O60245 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDH7O60245 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDH7O60245 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PCDH7O60245 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDH7O60245 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDH7O60245 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDH7O60245 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDH7O60245 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDH7O60245 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDH7O60245 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDH7O60245 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDH7O60245 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDH7O60245 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDH7O60245 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDH7O60245 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDH7O60245 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDH7O60245 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDH7O60245 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDH7O60245 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDH7O60245 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCDH7O60245 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCDH7O60245 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCDH7O60245 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCDH7O60245 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCDH7O60245 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCDH7O60245 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCDH7O60245 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCDH7O60245 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCDH7O60245 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PCDH7O60245 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCDH7O60245 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCDH7O60245 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCDH7O60245 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCDH7O60245 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCDH7O60245 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCDH7O60245 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCDH7O60245 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCDH7O60245 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDH7O60245 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDH7O60245 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDH7O60245 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDH7O60245 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDH7O60245 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDH7O60245 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDH7O60245 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDH7O60245 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDH7O60245 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDH7O60245 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDH7O60245 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDH7O60245 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDH7O60245 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDH7O60245 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDH7O60245 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDH7O60245 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDH7O60245 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDH7O60245 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDH7O60245 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDH7O60245 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDH7O60245 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCDH7O60245 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCDH7O60245 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCDH7O60245 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PCDH7O60245 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PCDH7O60245 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDH7O60245 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDH7O60245 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDH7O60245 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDH7O60245 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDH7O60245 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDH7O60245 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDH7O60245 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDH7O60245 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDH7O60245 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDH7O60245 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDH7O60245 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDH7O60245 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDH7O60245 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDH7O60245 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDH7O60245 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDH7O60245 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDH7O60245 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDH7O60245 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDH7O60245 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDH7O60245 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDH7O60245 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDH7O60245 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDH7O60245 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDH7O60245 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDH7O60245 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDH7O60245 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDH7O60245 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDH7O60245 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDH7O60245 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDH7O60245 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms