Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DENRO43583 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DENRO43583 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
DENRO43583 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DENRO43583 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DENRO43583 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DENRO43583 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DENRO43583 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DENRO43583 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DENRO43583 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DENRO43583 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DENRO43583 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DENRO43583 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DENRO43583 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DENRO43583 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DENRO43583 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DENRO43583 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DENRO43583 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DENRO43583 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DENRO43583 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DENRO43583 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DENRO43583 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DENRO43583 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DENRO43583 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DENRO43583 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DENRO43583 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DENRO43583 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DENRO43583 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DENRO43583 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DENRO43583 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DENRO43583 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DENRO43583 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DENRO43583 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DENRO43583 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DENRO43583 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DENRO43583 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DENRO43583 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DENRO43583 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DENRO43583 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DENRO43583 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DENRO43583 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DENRO43583 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DENRO43583 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DENRO43583 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DENRO43583 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DENRO43583 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DENRO43583 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DENRO43583 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DENRO43583 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DENRO43583 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DENRO43583 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DENRO43583 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DENRO43583 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DENRO43583 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DENRO43583 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DENRO43583 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DENRO43583 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DENRO43583 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DENRO43583 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DENRO43583 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DENRO43583 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DENRO43583 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DENRO43583 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DENRO43583 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DENRO43583 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DENRO43583 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
DENRO43583 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DENRO43583 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DENRO43583 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DENRO43583 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DENRO43583 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DENRO43583 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DENRO43583 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24■■□□□ 1.43
DENRO43583 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DENRO43583 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DENRO43583 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DENRO43583 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DENRO43583 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DENRO43583 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DENRO43583 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DENRO43583 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DENRO43583 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DENRO43583 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DENRO43583 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
DENRO43583 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DENRO43583 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DENRO43583 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DENRO43583 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
DENRO43583 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DENRO43583 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DENRO43583 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DENRO43583 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DENRO43583 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DENRO43583 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
DENRO43583 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DENRO43583 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DENRO43583 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DENRO43583 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DENRO43583 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DENRO43583 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms