Protein–RNA interactions for Protein: O43474

KLF4, Krueppel-like factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF4O43474 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLF4O43474 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLF4O43474 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLF4O43474 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KLF4O43474 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLF4O43474 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLF4O43474 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLF4O43474 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KLF4O43474 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLF4O43474 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLF4O43474 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLF4O43474 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLF4O43474 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLF4O43474 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLF4O43474 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KLF4O43474 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLF4O43474 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLF4O43474 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLF4O43474 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLF4O43474 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLF4O43474 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLF4O43474 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLF4O43474 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLF4O43474 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLF4O43474 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KLF4O43474 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KLF4O43474 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KLF4O43474 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLF4O43474 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLF4O43474 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLF4O43474 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLF4O43474 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLF4O43474 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLF4O43474 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLF4O43474 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLF4O43474 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLF4O43474 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLF4O43474 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLF4O43474 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLF4O43474 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLF4O43474 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLF4O43474 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLF4O43474 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLF4O43474 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLF4O43474 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLF4O43474 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLF4O43474 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLF4O43474 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLF4O43474 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLF4O43474 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLF4O43474 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLF4O43474 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLF4O43474 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLF4O43474 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLF4O43474 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLF4O43474 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLF4O43474 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLF4O43474 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KLF4O43474 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLF4O43474 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLF4O43474 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLF4O43474 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLF4O43474 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KLF4O43474 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLF4O43474 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLF4O43474 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLF4O43474 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLF4O43474 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLF4O43474 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLF4O43474 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLF4O43474 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLF4O43474 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLF4O43474 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
KLF4O43474 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLF4O43474 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLF4O43474 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLF4O43474 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLF4O43474 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLF4O43474 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLF4O43474 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLF4O43474 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLF4O43474 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLF4O43474 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLF4O43474 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLF4O43474 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLF4O43474 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLF4O43474 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLF4O43474 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLF4O43474 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLF4O43474 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLF4O43474 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLF4O43474 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLF4O43474 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLF4O43474 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLF4O43474 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLF4O43474 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLF4O43474 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLF4O43474 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLF4O43474 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLF4O43474 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms