Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
SGSM2O43147 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SGSM2O43147 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SGSM2O43147 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SGSM2O43147 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SGSM2O43147 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
SGSM2O43147 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
SGSM2O43147 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SGSM2O43147 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SGSM2O43147 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
SGSM2O43147 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SGSM2O43147 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SGSM2O43147 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
SGSM2O43147 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SGSM2O43147 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
SGSM2O43147 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
SGSM2O43147 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SGSM2O43147 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SGSM2O43147 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
SGSM2O43147 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
SGSM2O43147 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SGSM2O43147 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SGSM2O43147 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SGSM2O43147 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SGSM2O43147 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SGSM2O43147 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SGSM2O43147 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SGSM2O43147 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SGSM2O43147 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SGSM2O43147 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SGSM2O43147 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SGSM2O43147 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SGSM2O43147 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SGSM2O43147 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
SGSM2O43147 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
SGSM2O43147 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SGSM2O43147 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SGSM2O43147 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
SGSM2O43147 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SGSM2O43147 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
SGSM2O43147 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
SGSM2O43147 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
SGSM2O43147 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
SGSM2O43147 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SGSM2O43147 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SGSM2O43147 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SGSM2O43147 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
SGSM2O43147 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
SGSM2O43147 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
SGSM2O43147 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SGSM2O43147 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SGSM2O43147 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SGSM2O43147 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SGSM2O43147 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC31.14■■■□□ 2.58
SGSM2O43147 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
SGSM2O43147 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
SGSM2O43147 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
SGSM2O43147 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SGSM2O43147 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
SGSM2O43147 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SGSM2O43147 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SGSM2O43147 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
SGSM2O43147 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SGSM2O43147 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SGSM2O43147 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SGSM2O43147 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
SGSM2O43147 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SGSM2O43147 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SGSM2O43147 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SGSM2O43147 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SGSM2O43147 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SGSM2O43147 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SGSM2O43147 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SGSM2O43147 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SGSM2O43147 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SGSM2O43147 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SGSM2O43147 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SGSM2O43147 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SGSM2O43147 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SGSM2O43147 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SGSM2O43147 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SGSM2O43147 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SGSM2O43147 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SGSM2O43147 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SGSM2O43147 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SGSM2O43147 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SGSM2O43147 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
SGSM2O43147 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
SGSM2O43147 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
SGSM2O43147 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SGSM2O43147 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SGSM2O43147 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SGSM2O43147 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SGSM2O43147 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SGSM2O43147 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SGSM2O43147 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SGSM2O43147 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SGSM2O43147 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
SGSM2O43147 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SGSM2O43147 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms