Protein–RNA interactions for Protein: O15194

CTDSPL, CTD small phosphatase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPLO15194 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTDSPLO15194 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTDSPLO15194 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTDSPLO15194 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTDSPLO15194 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTDSPLO15194 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTDSPLO15194 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTDSPLO15194 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTDSPLO15194 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTDSPLO15194 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDSPLO15194 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDSPLO15194 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDSPLO15194 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDSPLO15194 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDSPLO15194 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDSPLO15194 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDSPLO15194 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDSPLO15194 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDSPLO15194 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDSPLO15194 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDSPLO15194 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDSPLO15194 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDSPLO15194 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDSPLO15194 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDSPLO15194 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDSPLO15194 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDSPLO15194 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDSPLO15194 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDSPLO15194 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDSPLO15194 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDSPLO15194 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDSPLO15194 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDSPLO15194 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDSPLO15194 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDSPLO15194 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTDSPLO15194 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTDSPLO15194 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTDSPLO15194 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTDSPLO15194 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTDSPLO15194 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTDSPLO15194 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTDSPLO15194 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTDSPLO15194 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTDSPLO15194 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTDSPLO15194 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTDSPLO15194 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTDSPLO15194 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTDSPLO15194 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTDSPLO15194 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTDSPLO15194 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTDSPLO15194 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTDSPLO15194 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTDSPLO15194 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTDSPLO15194 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTDSPLO15194 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTDSPLO15194 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTDSPLO15194 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTDSPLO15194 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTDSPLO15194 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTDSPLO15194 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTDSPLO15194 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTDSPLO15194 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTDSPLO15194 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDSPLO15194 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDSPLO15194 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDSPLO15194 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDSPLO15194 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDSPLO15194 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDSPLO15194 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDSPLO15194 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDSPLO15194 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDSPLO15194 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDSPLO15194 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDSPLO15194 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDSPLO15194 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTDSPLO15194 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTDSPLO15194 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CTDSPLO15194 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTDSPLO15194 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDSPLO15194 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDSPLO15194 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDSPLO15194 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDSPLO15194 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDSPLO15194 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDSPLO15194 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDSPLO15194 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDSPLO15194 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTDSPLO15194 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTDSPLO15194 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTDSPLO15194 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTDSPLO15194 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTDSPLO15194 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTDSPLO15194 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTDSPLO15194 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTDSPLO15194 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTDSPLO15194 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTDSPLO15194 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTDSPLO15194 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTDSPLO15194 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTDSPLO15194 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms