Protein–RNA interactions for Protein: O15127

SCAMP2, Secretory carrier-associated membrane protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP2O15127 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCAMP2O15127 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCAMP2O15127 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SCAMP2O15127 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCAMP2O15127 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCAMP2O15127 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCAMP2O15127 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCAMP2O15127 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SCAMP2O15127 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCAMP2O15127 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SCAMP2O15127 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCAMP2O15127 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCAMP2O15127 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCAMP2O15127 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCAMP2O15127 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCAMP2O15127 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCAMP2O15127 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCAMP2O15127 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCAMP2O15127 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCAMP2O15127 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCAMP2O15127 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCAMP2O15127 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCAMP2O15127 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAMP2O15127 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAMP2O15127 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCAMP2O15127 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCAMP2O15127 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCAMP2O15127 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAMP2O15127 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAMP2O15127 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAMP2O15127 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAMP2O15127 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAMP2O15127 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAMP2O15127 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAMP2O15127 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAMP2O15127 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAMP2O15127 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAMP2O15127 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAMP2O15127 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAMP2O15127 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAMP2O15127 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAMP2O15127 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAMP2O15127 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAMP2O15127 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAMP2O15127 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAMP2O15127 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAMP2O15127 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAMP2O15127 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAMP2O15127 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAMP2O15127 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAMP2O15127 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAMP2O15127 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAMP2O15127 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCAMP2O15127 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SCAMP2O15127 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCAMP2O15127 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCAMP2O15127 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCAMP2O15127 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCAMP2O15127 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCAMP2O15127 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAMP2O15127 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAMP2O15127 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAMP2O15127 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAMP2O15127 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAMP2O15127 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAMP2O15127 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAMP2O15127 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCAMP2O15127 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCAMP2O15127 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCAMP2O15127 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCAMP2O15127 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAMP2O15127 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAMP2O15127 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAMP2O15127 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAMP2O15127 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAMP2O15127 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAMP2O15127 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAMP2O15127 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCAMP2O15127 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCAMP2O15127 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCAMP2O15127 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCAMP2O15127 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCAMP2O15127 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCAMP2O15127 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCAMP2O15127 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCAMP2O15127 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCAMP2O15127 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCAMP2O15127 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCAMP2O15127 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCAMP2O15127 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAMP2O15127 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAMP2O15127 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAMP2O15127 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCAMP2O15127 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCAMP2O15127 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCAMP2O15127 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCAMP2O15127 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCAMP2O15127 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCAMP2O15127 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCAMP2O15127 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms