Protein–RNA interactions for Protein: O14843

FFAR3, Free fatty acid receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FFAR3O14843 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FFAR3O14843 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FFAR3O14843 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FFAR3O14843 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FFAR3O14843 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FFAR3O14843 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FFAR3O14843 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FFAR3O14843 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FFAR3O14843 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FFAR3O14843 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FFAR3O14843 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FFAR3O14843 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FFAR3O14843 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FFAR3O14843 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FFAR3O14843 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FFAR3O14843 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FFAR3O14843 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FFAR3O14843 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FFAR3O14843 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FFAR3O14843 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FFAR3O14843 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FFAR3O14843 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FFAR3O14843 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FFAR3O14843 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FFAR3O14843 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FFAR3O14843 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FFAR3O14843 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FFAR3O14843 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FFAR3O14843 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FFAR3O14843 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FFAR3O14843 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FFAR3O14843 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FFAR3O14843 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FFAR3O14843 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FFAR3O14843 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FFAR3O14843 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FFAR3O14843 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FFAR3O14843 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FFAR3O14843 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FFAR3O14843 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FFAR3O14843 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FFAR3O14843 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FFAR3O14843 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FFAR3O14843 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FFAR3O14843 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FFAR3O14843 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FFAR3O14843 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FFAR3O14843 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FFAR3O14843 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FFAR3O14843 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FFAR3O14843 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FFAR3O14843 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FFAR3O14843 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FFAR3O14843 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FFAR3O14843 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FFAR3O14843 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FFAR3O14843 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FFAR3O14843 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FFAR3O14843 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FFAR3O14843 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FFAR3O14843 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FFAR3O14843 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FFAR3O14843 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FFAR3O14843 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FFAR3O14843 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FFAR3O14843 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FFAR3O14843 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FFAR3O14843 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FFAR3O14843 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
FFAR3O14843 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
FFAR3O14843 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FFAR3O14843 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FFAR3O14843 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FFAR3O14843 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FFAR3O14843 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FFAR3O14843 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
FFAR3O14843 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FFAR3O14843 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FFAR3O14843 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FFAR3O14843 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FFAR3O14843 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FFAR3O14843 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FFAR3O14843 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FFAR3O14843 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FFAR3O14843 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FFAR3O14843 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FFAR3O14843 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FFAR3O14843 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
FFAR3O14843 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FFAR3O14843 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FFAR3O14843 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FFAR3O14843 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FFAR3O14843 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FFAR3O14843 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FFAR3O14843 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FFAR3O14843 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FFAR3O14843 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FFAR3O14843 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FFAR3O14843 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FFAR3O14843 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms