Protein–RNA interactions for Protein: O14818

PSMA7, Proteasome subunit alpha type-7, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA7O14818 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSMA7O14818 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSMA7O14818 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PSMA7O14818 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PSMA7O14818 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PSMA7O14818 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PSMA7O14818 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PSMA7O14818 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PSMA7O14818 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PSMA7O14818 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PSMA7O14818 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PSMA7O14818 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PSMA7O14818 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PSMA7O14818 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PSMA7O14818 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PSMA7O14818 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PSMA7O14818 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PSMA7O14818 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PSMA7O14818 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PSMA7O14818 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PSMA7O14818 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PSMA7O14818 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PSMA7O14818 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PSMA7O14818 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PSMA7O14818 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PSMA7O14818 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PSMA7O14818 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PSMA7O14818 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PSMA7O14818 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSMA7O14818 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSMA7O14818 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSMA7O14818 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PSMA7O14818 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PSMA7O14818 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PSMA7O14818 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PSMA7O14818 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PSMA7O14818 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PSMA7O14818 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PSMA7O14818 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PSMA7O14818 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PSMA7O14818 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PSMA7O14818 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PSMA7O14818 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PSMA7O14818 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PSMA7O14818 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PSMA7O14818 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PSMA7O14818 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PSMA7O14818 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PSMA7O14818 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PSMA7O14818 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PSMA7O14818 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PSMA7O14818 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PSMA7O14818 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PSMA7O14818 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PSMA7O14818 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PSMA7O14818 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PSMA7O14818 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PSMA7O14818 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PSMA7O14818 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PSMA7O14818 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PSMA7O14818 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PSMA7O14818 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSMA7O14818 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSMA7O14818 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSMA7O14818 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSMA7O14818 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSMA7O14818 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSMA7O14818 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSMA7O14818 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PSMA7O14818 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PSMA7O14818 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PSMA7O14818 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PSMA7O14818 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PSMA7O14818 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PSMA7O14818 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PSMA7O14818 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PSMA7O14818 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PSMA7O14818 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PSMA7O14818 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PSMA7O14818 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PSMA7O14818 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PSMA7O14818 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PSMA7O14818 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PSMA7O14818 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PSMA7O14818 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PSMA7O14818 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PSMA7O14818 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PSMA7O14818 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PSMA7O14818 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PSMA7O14818 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PSMA7O14818 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PSMA7O14818 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PSMA7O14818 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PSMA7O14818 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PSMA7O14818 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PSMA7O14818 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PSMA7O14818 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PSMA7O14818 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PSMA7O14818 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSMA7O14818 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms