Protein–RNA interactions for Protein: A6NLF2

ELOA3D, Elongin-A3 member D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELOA3DA6NLF2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ELOA3DA6NLF2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ELOA3DA6NLF2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ELOA3DA6NLF2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ELOA3DA6NLF2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ELOA3DA6NLF2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ELOA3DA6NLF2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ELOA3DA6NLF2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ELOA3DA6NLF2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ELOA3DA6NLF2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ELOA3DA6NLF2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ELOA3DA6NLF2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ELOA3DA6NLF2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ELOA3DA6NLF2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ELOA3DA6NLF2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ELOA3DA6NLF2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ELOA3DA6NLF2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ELOA3DA6NLF2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ELOA3DA6NLF2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
ELOA3DA6NLF2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ELOA3DA6NLF2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ELOA3DA6NLF2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ELOA3DA6NLF2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ELOA3DA6NLF2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ELOA3DA6NLF2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ELOA3DA6NLF2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ELOA3DA6NLF2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ELOA3DA6NLF2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ELOA3DA6NLF2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ELOA3DA6NLF2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ELOA3DA6NLF2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ELOA3DA6NLF2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ELOA3DA6NLF2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ELOA3DA6NLF2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ELOA3DA6NLF2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ELOA3DA6NLF2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ELOA3DA6NLF2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ELOA3DA6NLF2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ELOA3DA6NLF2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ELOA3DA6NLF2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ELOA3DA6NLF2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ELOA3DA6NLF2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ELOA3DA6NLF2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ELOA3DA6NLF2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ELOA3DA6NLF2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ELOA3DA6NLF2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ELOA3DA6NLF2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ELOA3DA6NLF2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ELOA3DA6NLF2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ELOA3DA6NLF2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ELOA3DA6NLF2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ELOA3DA6NLF2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ELOA3DA6NLF2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ELOA3DA6NLF2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ELOA3DA6NLF2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ELOA3DA6NLF2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ELOA3DA6NLF2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ELOA3DA6NLF2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ELOA3DA6NLF2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ELOA3DA6NLF2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ELOA3DA6NLF2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ELOA3DA6NLF2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ELOA3DA6NLF2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ELOA3DA6NLF2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ELOA3DA6NLF2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ELOA3DA6NLF2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ELOA3DA6NLF2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ELOA3DA6NLF2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ELOA3DA6NLF2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ELOA3DA6NLF2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ELOA3DA6NLF2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ELOA3DA6NLF2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ELOA3DA6NLF2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ELOA3DA6NLF2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ELOA3DA6NLF2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ELOA3DA6NLF2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ELOA3DA6NLF2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ELOA3DA6NLF2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ELOA3DA6NLF2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ELOA3DA6NLF2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ELOA3DA6NLF2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ELOA3DA6NLF2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ELOA3DA6NLF2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ELOA3DA6NLF2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ELOA3DA6NLF2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ELOA3DA6NLF2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ELOA3DA6NLF2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ELOA3DA6NLF2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ELOA3DA6NLF2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ELOA3DA6NLF2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ELOA3DA6NLF2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ELOA3DA6NLF2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ELOA3DA6NLF2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ELOA3DA6NLF2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ELOA3DA6NLF2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ELOA3DA6NLF2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ELOA3DA6NLF2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ELOA3DA6NLF2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ELOA3DA6NLF2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ELOA3DA6NLF2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms