Protein–RNA interactions for Protein: A6NGA9

TMEM202, Transmembrane protein 202, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM202A6NGA9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TMEM202A6NGA9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TMEM202A6NGA9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM202A6NGA9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM202A6NGA9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM202A6NGA9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM202A6NGA9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM202A6NGA9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM202A6NGA9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM202A6NGA9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM202A6NGA9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM202A6NGA9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM202A6NGA9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM202A6NGA9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM202A6NGA9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM202A6NGA9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM202A6NGA9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM202A6NGA9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM202A6NGA9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
TMEM202A6NGA9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM202A6NGA9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM202A6NGA9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM202A6NGA9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM202A6NGA9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM202A6NGA9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM202A6NGA9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM202A6NGA9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM202A6NGA9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM202A6NGA9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM202A6NGA9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM202A6NGA9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM202A6NGA9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM202A6NGA9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM202A6NGA9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM202A6NGA9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM202A6NGA9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM202A6NGA9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM202A6NGA9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM202A6NGA9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM202A6NGA9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM202A6NGA9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM202A6NGA9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM202A6NGA9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM202A6NGA9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM202A6NGA9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM202A6NGA9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM202A6NGA9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM202A6NGA9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM202A6NGA9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM202A6NGA9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM202A6NGA9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM202A6NGA9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM202A6NGA9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM202A6NGA9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM202A6NGA9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM202A6NGA9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM202A6NGA9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM202A6NGA9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM202A6NGA9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM202A6NGA9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM202A6NGA9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM202A6NGA9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM202A6NGA9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM202A6NGA9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM202A6NGA9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM202A6NGA9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM202A6NGA9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM202A6NGA9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM202A6NGA9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM202A6NGA9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM202A6NGA9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM202A6NGA9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM202A6NGA9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM202A6NGA9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM202A6NGA9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM202A6NGA9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM202A6NGA9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM202A6NGA9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM202A6NGA9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM202A6NGA9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM202A6NGA9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM202A6NGA9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM202A6NGA9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM202A6NGA9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMEM202A6NGA9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM202A6NGA9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM202A6NGA9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM202A6NGA9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM202A6NGA9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM202A6NGA9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM202A6NGA9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM202A6NGA9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM202A6NGA9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM202A6NGA9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM202A6NGA9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM202A6NGA9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM202A6NGA9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM202A6NGA9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM202A6NGA9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM202A6NGA9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms