Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HELTA6NFD8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HELTA6NFD8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HELTA6NFD8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HELTA6NFD8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HELTA6NFD8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HELTA6NFD8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HELTA6NFD8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HELTA6NFD8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HELTA6NFD8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HELTA6NFD8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HELTA6NFD8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HELTA6NFD8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HELTA6NFD8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HELTA6NFD8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HELTA6NFD8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HELTA6NFD8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HELTA6NFD8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HELTA6NFD8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HELTA6NFD8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HELTA6NFD8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HELTA6NFD8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HELTA6NFD8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HELTA6NFD8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HELTA6NFD8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HELTA6NFD8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HELTA6NFD8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HELTA6NFD8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HELTA6NFD8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HELTA6NFD8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HELTA6NFD8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HELTA6NFD8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HELTA6NFD8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HELTA6NFD8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HELTA6NFD8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HELTA6NFD8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HELTA6NFD8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HELTA6NFD8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HELTA6NFD8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HELTA6NFD8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HELTA6NFD8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HELTA6NFD8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HELTA6NFD8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HELTA6NFD8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HELTA6NFD8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HELTA6NFD8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HELTA6NFD8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HELTA6NFD8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HELTA6NFD8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HELTA6NFD8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HELTA6NFD8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HELTA6NFD8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HELTA6NFD8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HELTA6NFD8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HELTA6NFD8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HELTA6NFD8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HELTA6NFD8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HELTA6NFD8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HELTA6NFD8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HELTA6NFD8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HELTA6NFD8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HELTA6NFD8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HELTA6NFD8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HELTA6NFD8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HELTA6NFD8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HELTA6NFD8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HELTA6NFD8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HELTA6NFD8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HELTA6NFD8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HELTA6NFD8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HELTA6NFD8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HELTA6NFD8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HELTA6NFD8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HELTA6NFD8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HELTA6NFD8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HELTA6NFD8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HELTA6NFD8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HELTA6NFD8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HELTA6NFD8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HELTA6NFD8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HELTA6NFD8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HELTA6NFD8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HELTA6NFD8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HELTA6NFD8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HELTA6NFD8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HELTA6NFD8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HELTA6NFD8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HELTA6NFD8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HELTA6NFD8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HELTA6NFD8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HELTA6NFD8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HELTA6NFD8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HELTA6NFD8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HELTA6NFD8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HELTA6NFD8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HELTA6NFD8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HELTA6NFD8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HELTA6NFD8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HELTA6NFD8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HELTA6NFD8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms