Protein–RNA interactions for Protein: A6NED2

RCCD1, RCC1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCCD1A6NED2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RCCD1A6NED2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RCCD1A6NED2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RCCD1A6NED2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RCCD1A6NED2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RCCD1A6NED2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RCCD1A6NED2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RCCD1A6NED2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RCCD1A6NED2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RCCD1A6NED2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RCCD1A6NED2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RCCD1A6NED2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RCCD1A6NED2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RCCD1A6NED2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RCCD1A6NED2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RCCD1A6NED2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RCCD1A6NED2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RCCD1A6NED2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RCCD1A6NED2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RCCD1A6NED2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RCCD1A6NED2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RCCD1A6NED2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RCCD1A6NED2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RCCD1A6NED2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RCCD1A6NED2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RCCD1A6NED2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RCCD1A6NED2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RCCD1A6NED2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RCCD1A6NED2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RCCD1A6NED2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RCCD1A6NED2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RCCD1A6NED2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RCCD1A6NED2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RCCD1A6NED2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RCCD1A6NED2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RCCD1A6NED2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RCCD1A6NED2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RCCD1A6NED2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RCCD1A6NED2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RCCD1A6NED2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RCCD1A6NED2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RCCD1A6NED2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RCCD1A6NED2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RCCD1A6NED2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
RCCD1A6NED2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RCCD1A6NED2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RCCD1A6NED2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RCCD1A6NED2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RCCD1A6NED2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RCCD1A6NED2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RCCD1A6NED2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RCCD1A6NED2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RCCD1A6NED2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RCCD1A6NED2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RCCD1A6NED2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RCCD1A6NED2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
RCCD1A6NED2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RCCD1A6NED2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
RCCD1A6NED2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RCCD1A6NED2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RCCD1A6NED2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RCCD1A6NED2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RCCD1A6NED2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RCCD1A6NED2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RCCD1A6NED2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RCCD1A6NED2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RCCD1A6NED2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RCCD1A6NED2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
RCCD1A6NED2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RCCD1A6NED2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RCCD1A6NED2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RCCD1A6NED2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RCCD1A6NED2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RCCD1A6NED2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RCCD1A6NED2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RCCD1A6NED2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RCCD1A6NED2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RCCD1A6NED2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RCCD1A6NED2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RCCD1A6NED2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RCCD1A6NED2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RCCD1A6NED2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RCCD1A6NED2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RCCD1A6NED2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RCCD1A6NED2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RCCD1A6NED2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RCCD1A6NED2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RCCD1A6NED2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RCCD1A6NED2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RCCD1A6NED2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RCCD1A6NED2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RCCD1A6NED2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RCCD1A6NED2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RCCD1A6NED2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RCCD1A6NED2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RCCD1A6NED2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RCCD1A6NED2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RCCD1A6NED2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RCCD1A6NED2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RCCD1A6NED2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms