Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT87PA6NCN2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT87PA6NCN2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT87PA6NCN2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT87PA6NCN2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT87PA6NCN2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT87PA6NCN2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT87PA6NCN2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT87PA6NCN2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT87PA6NCN2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT87PA6NCN2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT87PA6NCN2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT87PA6NCN2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT87PA6NCN2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT87PA6NCN2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT87PA6NCN2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT87PA6NCN2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT87PA6NCN2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT87PA6NCN2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT87PA6NCN2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT87PA6NCN2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT87PA6NCN2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT87PA6NCN2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT87PA6NCN2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT87PA6NCN2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT87PA6NCN2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT87PA6NCN2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT87PA6NCN2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT87PA6NCN2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT87PA6NCN2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT87PA6NCN2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT87PA6NCN2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT87PA6NCN2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT87PA6NCN2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT87PA6NCN2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT87PA6NCN2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT87PA6NCN2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT87PA6NCN2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT87PA6NCN2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT87PA6NCN2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT87PA6NCN2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT87PA6NCN2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT87PA6NCN2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT87PA6NCN2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT87PA6NCN2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT87PA6NCN2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT87PA6NCN2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT87PA6NCN2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT87PA6NCN2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT87PA6NCN2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT87PA6NCN2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT87PA6NCN2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT87PA6NCN2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT87PA6NCN2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT87PA6NCN2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT87PA6NCN2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT87PA6NCN2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT87PA6NCN2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT87PA6NCN2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT87PA6NCN2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT87PA6NCN2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT87PA6NCN2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT87PA6NCN2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT87PA6NCN2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT87PA6NCN2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT87PA6NCN2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT87PA6NCN2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT87PA6NCN2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT87PA6NCN2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT87PA6NCN2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT87PA6NCN2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT87PA6NCN2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT87PA6NCN2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT87PA6NCN2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT87PA6NCN2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT87PA6NCN2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT87PA6NCN2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT87PA6NCN2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT87PA6NCN2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT87PA6NCN2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT87PA6NCN2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT87PA6NCN2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT87PA6NCN2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT87PA6NCN2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT87PA6NCN2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT87PA6NCN2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT87PA6NCN2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT87PA6NCN2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT87PA6NCN2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT87PA6NCN2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT87PA6NCN2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT87PA6NCN2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT87PA6NCN2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT87PA6NCN2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT87PA6NCN2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT87PA6NCN2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT87PA6NCN2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KRT87PA6NCN2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT87PA6NCN2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT87PA6NCN2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms