Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
LAMB4A4D0S4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
LAMB4A4D0S4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
LAMB4A4D0S4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
LAMB4A4D0S4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
LAMB4A4D0S4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
LAMB4A4D0S4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
LAMB4A4D0S4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
LAMB4A4D0S4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
LAMB4A4D0S4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
LAMB4A4D0S4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
LAMB4A4D0S4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
LAMB4A4D0S4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
LAMB4A4D0S4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
LAMB4A4D0S4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
LAMB4A4D0S4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
LAMB4A4D0S4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
LAMB4A4D0S4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
LAMB4A4D0S4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
LAMB4A4D0S4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
LAMB4A4D0S4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
LAMB4A4D0S4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
LAMB4A4D0S4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
LAMB4A4D0S4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
LAMB4A4D0S4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
LAMB4A4D0S4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
LAMB4A4D0S4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
LAMB4A4D0S4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
LAMB4A4D0S4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
LAMB4A4D0S4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
LAMB4A4D0S4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
LAMB4A4D0S4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
LAMB4A4D0S4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
LAMB4A4D0S4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
LAMB4A4D0S4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
LAMB4A4D0S4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
LAMB4A4D0S4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
LAMB4A4D0S4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
LAMB4A4D0S4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
LAMB4A4D0S4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
LAMB4A4D0S4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
LAMB4A4D0S4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
LAMB4A4D0S4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
LAMB4A4D0S4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
LAMB4A4D0S4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
LAMB4A4D0S4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC33.33■■■□□ 2.93
LAMB4A4D0S4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
LAMB4A4D0S4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
LAMB4A4D0S4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
LAMB4A4D0S4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
LAMB4A4D0S4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
LAMB4A4D0S4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
LAMB4A4D0S4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
LAMB4A4D0S4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
LAMB4A4D0S4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
LAMB4A4D0S4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
LAMB4A4D0S4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
LAMB4A4D0S4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
LAMB4A4D0S4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
LAMB4A4D0S4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
LAMB4A4D0S4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
LAMB4A4D0S4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
LAMB4A4D0S4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
LAMB4A4D0S4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
LAMB4A4D0S4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
LAMB4A4D0S4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
LAMB4A4D0S4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
LAMB4A4D0S4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
LAMB4A4D0S4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
LAMB4A4D0S4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
LAMB4A4D0S4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
LAMB4A4D0S4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
LAMB4A4D0S4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
LAMB4A4D0S4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
LAMB4A4D0S4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
LAMB4A4D0S4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
LAMB4A4D0S4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
LAMB4A4D0S4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
LAMB4A4D0S4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
LAMB4A4D0S4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
LAMB4A4D0S4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
LAMB4A4D0S4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
LAMB4A4D0S4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
LAMB4A4D0S4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.89
LAMB4A4D0S4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
LAMB4A4D0S4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
LAMB4A4D0S4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
LAMB4A4D0S4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
LAMB4A4D0S4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
LAMB4A4D0S4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
LAMB4A4D0S4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
LAMB4A4D0S4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
LAMB4A4D0S4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
LAMB4A4D0S4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
LAMB4A4D0S4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
LAMB4A4D0S4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
LAMB4A4D0S4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
LAMB4A4D0S4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
LAMB4A4D0S4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
LAMB4A4D0S4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms