Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
E2F8A0AVK6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
E2F8A0AVK6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
E2F8A0AVK6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
E2F8A0AVK6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
E2F8A0AVK6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
E2F8A0AVK6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
E2F8A0AVK6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
E2F8A0AVK6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
E2F8A0AVK6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
E2F8A0AVK6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
E2F8A0AVK6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
E2F8A0AVK6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
E2F8A0AVK6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
E2F8A0AVK6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
E2F8A0AVK6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
E2F8A0AVK6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
E2F8A0AVK6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
E2F8A0AVK6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
E2F8A0AVK6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
E2F8A0AVK6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
E2F8A0AVK6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
E2F8A0AVK6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
E2F8A0AVK6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
E2F8A0AVK6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
E2F8A0AVK6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
E2F8A0AVK6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
E2F8A0AVK6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
E2F8A0AVK6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
E2F8A0AVK6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
E2F8A0AVK6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
E2F8A0AVK6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
E2F8A0AVK6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
E2F8A0AVK6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
E2F8A0AVK6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
E2F8A0AVK6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
E2F8A0AVK6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
E2F8A0AVK6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
E2F8A0AVK6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
E2F8A0AVK6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
E2F8A0AVK6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
E2F8A0AVK6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
E2F8A0AVK6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
E2F8A0AVK6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
E2F8A0AVK6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
E2F8A0AVK6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
E2F8A0AVK6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
E2F8A0AVK6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
E2F8A0AVK6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
E2F8A0AVK6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
E2F8A0AVK6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27■■□□□ 1.91
E2F8A0AVK6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
E2F8A0AVK6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
E2F8A0AVK6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
E2F8A0AVK6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
E2F8A0AVK6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
E2F8A0AVK6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
E2F8A0AVK6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
E2F8A0AVK6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
E2F8A0AVK6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
E2F8A0AVK6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
E2F8A0AVK6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
E2F8A0AVK6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
E2F8A0AVK6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
E2F8A0AVK6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
E2F8A0AVK6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
E2F8A0AVK6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
E2F8A0AVK6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
E2F8A0AVK6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
E2F8A0AVK6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
E2F8A0AVK6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
E2F8A0AVK6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
E2F8A0AVK6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
E2F8A0AVK6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
E2F8A0AVK6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
E2F8A0AVK6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
E2F8A0AVK6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
E2F8A0AVK6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
E2F8A0AVK6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
E2F8A0AVK6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
E2F8A0AVK6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
E2F8A0AVK6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
E2F8A0AVK6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
E2F8A0AVK6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
E2F8A0AVK6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
E2F8A0AVK6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
E2F8A0AVK6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
E2F8A0AVK6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
E2F8A0AVK6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
E2F8A0AVK6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
E2F8A0AVK6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
E2F8A0AVK6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
E2F8A0AVK6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
E2F8A0AVK6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
E2F8A0AVK6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
E2F8A0AVK6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
E2F8A0AVK6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
E2F8A0AVK6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
E2F8A0AVK6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
E2F8A0AVK6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms