Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YWV2

TRBV4-1, T-cell receptor beta variable 4-1 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRBV4-1A0A0J9YWV2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRBV4-1A0A0J9YWV2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRBV4-1A0A0J9YWV2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRBV4-1A0A0J9YWV2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRBV4-1A0A0J9YWV2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRBV4-1A0A0J9YWV2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRBV4-1A0A0J9YWV2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRBV4-1A0A0J9YWV2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRBV4-1A0A0J9YWV2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRBV4-1A0A0J9YWV2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRBV4-1A0A0J9YWV2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRBV4-1A0A0J9YWV2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRBV4-1A0A0J9YWV2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRBV4-1A0A0J9YWV2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRBV4-1A0A0J9YWV2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRBV4-1A0A0J9YWV2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRBV4-1A0A0J9YWV2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRBV4-1A0A0J9YWV2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRBV4-1A0A0J9YWV2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRBV4-1A0A0J9YWV2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRBV4-1A0A0J9YWV2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TRBV4-1A0A0J9YWV2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
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