Protein–RNA interactions for Protein: A0A088AWK7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A088AWK7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A088AWK7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A088AWK7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A088AWK7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
A0A088AWK7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A088AWK7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A088AWK7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A088AWK7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A088AWK7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A088AWK7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A088AWK7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A088AWK7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A088AWK7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A088AWK7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A088AWK7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A088AWK7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A088AWK7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A088AWK7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A088AWK7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A088AWK7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A088AWK7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A088AWK7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A088AWK7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A088AWK7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A088AWK7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A088AWK7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A088AWK7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A088AWK7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A088AWK7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A088AWK7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A088AWK7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A088AWK7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A088AWK7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A088AWK7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A088AWK7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A088AWK7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A088AWK7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A088AWK7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A088AWK7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A088AWK7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A088AWK7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A088AWK7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A088AWK7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A088AWK7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A088AWK7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A088AWK7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A088AWK7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A088AWK7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A088AWK7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A088AWK7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A088AWK7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A088AWK7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A088AWK7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A088AWK7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A088AWK7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A088AWK7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A088AWK7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A088AWK7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A088AWK7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A088AWK7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A088AWK7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A088AWK7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A088AWK7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A088AWK7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A088AWK7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A088AWK7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A088AWK7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A088AWK7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A088AWK7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A088AWK7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A088AWK7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A088AWK7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A088AWK7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A088AWK7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A088AWK7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
A0A088AWK7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A088AWK7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A088AWK7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A088AWK7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A088AWK7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A088AWK7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A088AWK7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A088AWK7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A088AWK7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A088AWK7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A088AWK7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A088AWK7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A088AWK7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A088AWK7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A088AWK7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A088AWK7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A088AWK7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A088AWK7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A088AWK7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A088AWK7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A088AWK7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A088AWK7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A088AWK7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
A0A088AWK7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
A0A088AWK7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms