Protein–RNA interactions for Protein: Q01196

RUNX1, Runt-related transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1Q01196 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
RUNX1Q01196 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RUNX1Q01196 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms