Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

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Length 1,094 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SEC24CP53992 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEC24CP53992 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEC24CP53992 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEC24CP53992 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEC24CP53992 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEC24CP53992 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEC24CP53992 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEC24CP53992 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEC24CP53992 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEC24CP53992 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC24CP53992 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC24CP53992 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC24CP53992 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC24CP53992 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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SEC24CP53992 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC24CP53992 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC24CP53992 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC24CP53992 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC24CP53992 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC24CP53992 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC24CP53992 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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SEC24CP53992 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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SEC24CP53992 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC24CP53992 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC24CP53992 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC24CP53992 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC24CP53992 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC24CP53992 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC24CP53992 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC24CP53992 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC24CP53992 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC24CP53992 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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SEC24CP53992 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC24CP53992 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC24CP53992 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC24CP53992 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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SEC24CP53992 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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SEC24CP53992 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEC24CP53992 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEC24CP53992 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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SEC24CP53992 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEC24CP53992 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEC24CP53992 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEC24CP53992 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEC24CP53992 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEC24CP53992 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEC24CP53992 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEC24CP53992 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEC24CP53992 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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SEC24CP53992 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEC24CP53992 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEC24CP53992 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEC24CP53992 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEC24CP53992 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEC24CP53992 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEC24CP53992 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEC24CP53992 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SEC24CP53992 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEC24CP53992 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEC24CP53992 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEC24CP53992 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SEC24CP53992 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEC24CP53992 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEC24CP53992 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEC24CP53992 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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