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Protein–RNA interactions for Protein: P53253
NNF2, Protein NNF2, yeast
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936 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
NNF2
P53253
MEC1
YBR136W
7107 nt
1.6
□□□□□ -2.15
NNF2
P53253
ALK1
YGL021W
2283 nt
1.6
□□□□□ -2.15
NNF2
P53253
BST1
YFL025C
3090 nt
1.59
□□□□□ -2.15
NNF2
P53253
RPL34B
YIL052C
366 nt
1.59
□□□□□ -2.15
NNF2
P53253
YIR044C
YIR044C
186 nt
1.59
□□□□□ -2.15
NNF2
P53253
COF1
YLL050C
432 nt
1.59
□□□□□ -2.15
NNF2
P53253
KAP122
YGL016W
3246 nt
1.59
□□□□□ -2.16
NNF2
P53253
SMC4
YLR086W
4257 nt
1.58
□□□□□ -2.16
NNF2
P53253
VIK1
YPL253C
1944 nt
1.58
□□□□□ -2.16
NNF2
P53253
YNL028W
YNL028W
318 nt
1.58
□□□□□ -2.16
NNF2
P53253
CSE2
YNR010W
450 nt
1.58
□□□□□ -2.16
NNF2
P53253
AI5_ALPHA
Q0070
1893 nt
1.58
□□□□□ -2.16
NNF2
P53253
SEC21
YNL287W
2808 nt
1.57
□□□□□ -2.16
NNF2
P53253
YLR140W
YLR140W
327 nt
1.57
□□□□□ -2.16
NNF2
P53253
YMR172C-A
YMR172C-A
384 nt
1.57
□□□□□ -2.16
NNF2
P53253
PBY1
YBR094W
2262 nt
1.57
□□□□□ -2.16
NNF2
P53253
ALY2
YJL084C
3141 nt
1.57
□□□□□ -2.16
NNF2
P53253
NCA2
YPR155C
1851 nt
1.56
□□□□□ -2.16
NNF2
P53253
YJL120W
YJL120W
324 nt
1.56
□□□□□ -2.16
NNF2
P53253
YLR120W-A
YLR120W-A
102 nt
1.56
□□□□□ -2.16
NNF2
P53253
YOR015W
YOR015W
360 nt
1.55
□□□□□ -2.16
NNF2
P53253
VPS54
YDR027C
2670 nt
1.55
□□□□□ -2.16
NNF2
P53253
PIP2
YOR363C
2991 nt
1.55
□□□□□ -2.16
NNF2
P53253
CDC36
YDL165W
576 nt
1.54
□□□□□ -2.16
NNF2
P53253
YBL008W-A
YBL008W-A
240 nt
1.54
□□□□□ -2.16
NNF2
P53253
YMR321C
YMR321C
318 nt
1.54
□□□□□ -2.16
NNF2
P53253
IFH1
YLR223C
3258 nt
1.54
□□□□□ -2.16
NNF2
P53253
TRM732
YMR259C
4263 nt
1.54
□□□□□ -2.16
NNF2
P53253
MSH3
YCR092C
3057 nt
1.53
□□□□□ -2.16
NNF2
P53253
UFD2
YDL190C
2886 nt
1.53
□□□□□ -2.16
NNF2
P53253
VPS55
YJR044C
423 nt
1.53
□□□□□ -2.16
NNF2
P53253
RPS25B
YLR333C
327 nt
1.53
□□□□□ -2.16
NNF2
P53253
YBR064W
YBR064W
429 nt
1.53
□□□□□ -2.16
NNF2
P53253
snR49
snR49
165 nt
1.53
□□□□□ -2.16
NNF2
P53253
SEC5
YDR166C
2916 nt
1.53
□□□□□ -2.17
NNF2
P53253
SLI15
YBR156C
2097 nt
1.52
□□□□□ -2.17
NNF2
P53253
RAD50
YNL250W
3939 nt
1.52
□□□□□ -2.17
NNF2
P53253
SPO21
YOL091W
1830 nt
1.52
□□□□□ -2.17
NNF2
P53253
AHC1
YOR023C
1701 nt
1.52
□□□□□ -2.17
NNF2
P53253
COG4
YPR105C
2586 nt
1.52
□□□□□ -2.17
NNF2
P53253
YGL188C-A
YGL188C-A
141 nt
1.52
□□□□□ -2.17
NNF2
P53253
YJL197C-A
YJL197C-A
282 nt
1.52
□□□□□ -2.17
NNF2
P53253
CUL3
YGR003W
2235 nt
1.51
□□□□□ -2.17
NNF2
P53253
YDR521W
YDR521W
336 nt
1.51
□□□□□ -2.17
NNF2
P53253
RPS27B
YHR021C
249 nt
1.51
□□□□□ -2.17
NNF2
P53253
YOR011W-A
YOR011W-A
207 nt
1.51
□□□□□ -2.17
NNF2
P53253
IES4
YOR189W
351 nt
1.51
□□□□□ -2.17
NNF2
P53253
YOR376W
YOR376W
369 nt
1.51
□□□□□ -2.17
NNF2
P53253
PDE2
YOR360C
1581 nt
1.51
□□□□□ -2.17
NNF2
P53253
YGL052W
YGL052W
306 nt
1.5
□□□□□ -2.17
NNF2
P53253
YMR158W-B
YMR158W-B
321 nt
1.5
□□□□□ -2.17
NNF2
P53253
COA6
YMR244C-A
315 nt
1.5
□□□□□ -2.17
NNF2
P53253
YLL007C
YLL007C
1998 nt
1.5
□□□□□ -2.17
NNF2
P53253
PTP2
YOR208W
2253 nt
1.5
□□□□□ -2.17
NNF2
P53253
CAT8
YMR280C
4302 nt
1.49
□□□□□ -2.17
NNF2
P53253
YGL217C
YGL217C
342 nt
1.49
□□□□□ -2.17
NNF2
P53253
STF2
YGR008C
255 nt
1.49
□□□□□ -2.17
NNF2
P53253
YIL020C-A
YIL020C-A
339 nt
1.48
□□□□□ -2.17
NNF2
P53253
HUG1
YML058W-A
207 nt
1.48
□□□□□ -2.17
NNF2
P53253
SLX4
YLR135W
2247 nt
1.48
□□□□□ -2.17
NNF2
P53253
EST2
YLR318W
2655 nt
1.48
□□□□□ -2.17
NNF2
P53253
PAN2
YGL094C
3348 nt
1.48
□□□□□ -2.17
NNF2
P53253
YOR218C
YOR218C
420 nt
1.47
□□□□□ -2.17
NNF2
P53253
CDC31
YOR257W
486 nt
1.47
□□□□□ -2.17
NNF2
P53253
YBR206W
YBR206W
324 nt
1.47
□□□□□ -2.17
NNF2
P53253
snR80
snR80
171 nt
1.46
□□□□□ -2.18
NNF2
P53253
tF(GAA)Q
tF(GAA)Q
75 nt
1.46
□□□□□ -2.18
NNF2
P53253
ABF2
YMR072W
552 nt
1.46
□□□□□ -2.18
NNF2
P53253
YOL155W-A
YOL155W-A
135 nt
1.46
□□□□□ -2.18
NNF2
P53253
RAD9
YDR217C
3930 nt
1.46
□□□□□ -2.18
NNF2
P53253
PKH2
YOL100W
3246 nt
1.45
□□□□□ -2.18
NNF2
P53253
MDS3
YGL197W
4464 nt
1.44
□□□□□ -2.18
NNF2
P53253
YMR307C-A
YMR307C-A
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1.44
□□□□□ -2.18
NNF2
P53253
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YOR161W-B
261 nt
1.44
□□□□□ -2.18
NNF2
P53253
snR14
snR14
160 nt
1.44
□□□□□ -2.18
NNF2
P53253
AZF1
YOR113W
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1.44
□□□□□ -2.18
NNF2
P53253
NUP188
YML103C
4968 nt
1.44
□□□□□ -2.18
NNF2
P53253
snR55
snR55
98 nt
1.43
□□□□□ -2.18
NNF2
P53253
YGL041C
YGL041C
204 nt
1.43
□□□□□ -2.18
NNF2
P53253
YPR092W
YPR092W
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1.43
□□□□□ -2.18
NNF2
P53253
RSM22
YKL155C
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1.43
□□□□□ -2.18
NNF2
P53253
YGR130C
YGR130C
2451 nt
1.43
□□□□□ -2.18
NNF2
P53253
GPG1
YGL121C
381 nt
1.42
□□□□□ -2.18
NNF2
P53253
PFD1
YJL179W
330 nt
1.42
□□□□□ -2.18
NNF2
P53253
SWI4
YER111C
3282 nt
1.41
□□□□□ -2.18
NNF2
P53253
NPR2
YEL062W
1848 nt
1.4
□□□□□ -2.18
NNF2
P53253
CLU1
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3834 nt
1.4
□□□□□ -2.18
NNF2
P53253
SGF11
YPL047W
300 nt
1.4
□□□□□ -2.19
NNF2
P53253
SLD3
YGL113W
2007 nt
1.4
□□□□□ -2.19
NNF2
P53253
YDL206W
YDL206W
2289 nt
1.4
□□□□□ -2.19
NNF2
P53253
MMS4
YBR098W
2076 nt
1.39
□□□□□ -2.19
NNF2
P53253
YLL054C
YLL054C
2532 nt
1.39
□□□□□ -2.19
NNF2
P53253
MSN5
YDR335W
3675 nt
1.39
□□□□□ -2.19
NNF2
P53253
snR74
snR74
88 nt
1.39
□□□□□ -2.19
NNF2
P53253
SPG3
YDR504C
384 nt
1.39
□□□□□ -2.19
NNF2
P53253
MCM10
YIL150C
1716 nt
1.39
□□□□□ -2.19
NNF2
P53253
ROM2
YLR371W
4071 nt
1.38
□□□□□ -2.19
NNF2
P53253
APL3
YBL037W
3078 nt
1.37
□□□□□ -2.19
NNF2
P53253
RRT15
YLR162W-A
189 nt
1.37
□□□□□ -2.19
NNF2
P53253
YIR030W-A
YIR030W-A
384 nt
1.36
□□□□□ -2.19
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