Protein–RNA interactions for Protein: O14618

CCS, Copper chaperone for superoxide dismutase, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSO14618 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCSO14618 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCSO14618 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCSO14618 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCSO14618 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCSO14618 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCSO14618 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCSO14618 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCSO14618 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCSO14618 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCSO14618 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCSO14618 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCSO14618 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCSO14618 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCSO14618 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCSO14618 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCSO14618 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCSO14618 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCSO14618 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCSO14618 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCSO14618 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCSO14618 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCSO14618 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCSO14618 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCSO14618 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCSO14618 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCSO14618 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCSO14618 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCSO14618 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCSO14618 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCSO14618 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCSO14618 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCSO14618 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCSO14618 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCSO14618 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCSO14618 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCSO14618 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCSO14618 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCSO14618 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCSO14618 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCSO14618 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCSO14618 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCSO14618 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCSO14618 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCSO14618 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCSO14618 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCSO14618 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCSO14618 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCSO14618 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCSO14618 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCSO14618 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCSO14618 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCSO14618 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCSO14618 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCSO14618 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCSO14618 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCSO14618 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCSO14618 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCSO14618 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCSO14618 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCSO14618 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCSO14618 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSO14618 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSO14618 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSO14618 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSO14618 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSO14618 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSO14618 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSO14618 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSO14618 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSO14618 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSO14618 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSO14618 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSO14618 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSO14618 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSO14618 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSO14618 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSO14618 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSO14618 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSO14618 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSO14618 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSO14618 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSO14618 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSO14618 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSO14618 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSO14618 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSO14618 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSO14618 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSO14618 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSO14618 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSO14618 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCSO14618 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCSO14618 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCSO14618 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCSO14618 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCSO14618 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCSO14618 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCSO14618 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCSO14618 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCSO14618 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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