Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3KRW8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3KRW8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3KRW8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3KRW8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3KRW8 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3KRW8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3KRW8 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3KRW8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3KRW8 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3KRW8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3KRW8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3KRW8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3KRW8 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3KRW8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3KRW8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3KRW8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3KRW8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3KRW8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3KRW8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
J3KRW8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3KRW8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3KRW8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3KRW8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3KRW8 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3KRW8 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3KRW8 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3KRW8 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3KRW8 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3KRW8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3KRW8 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3KRW8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
J3KRW8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3KRW8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3KRW8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3KRW8 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3KRW8 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3KRW8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3KRW8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3KRW8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3KRW8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
J3KRW8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3KRW8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3KRW8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3KRW8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3KRW8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3KRW8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
J3KRW8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3KRW8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3KRW8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3KRW8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3KRW8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3KRW8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3KRW8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3KRW8 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3KRW8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3KRW8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3KRW8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3KRW8 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3KRW8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3KRW8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3KRW8 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3KRW8 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3KRW8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3KRW8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3KRW8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
J3KRW8 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3KRW8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3KRW8 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3KRW8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3KRW8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3KRW8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3KRW8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3KRW8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3KRW8 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3KRW8 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3KRW8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3KRW8 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3KRW8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3KRW8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3KRW8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3KRW8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3KRW8 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3KRW8 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3KRW8 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3KRW8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3KRW8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3KRW8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3KRW8 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3KRW8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3KRW8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3KRW8 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3KRW8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3KRW8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3KRW8 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3KRW8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3KRW8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3KRW8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3KRW8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
J3KRW8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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