Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms