Protein–RNA interactions for Protein: Q12745

SEC39, Protein transport protein SEC39, yeastyeast

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC39Q12745 EMC5YIL027C 426 nt1.55□□□□□ -2.16
SEC39Q12745 YJL022WYJL022W 309 nt1.55□□□□□ -2.16
SEC39Q12745 SMC4YLR086W 4257 nt1.54□□□□□ -2.16
SEC39Q12745 BST1YFL025C 3090 nt1.54□□□□□ -2.16
SEC39Q12745 RPS20YHL015W 366 nt1.54□□□□□ -2.16
SEC39Q12745 YJL135WYJL135W 318 nt1.54□□□□□ -2.16
SEC39Q12745 COF1YLL050C 432 nt1.54□□□□□ -2.16
SEC39Q12745 RPL38YLR325C 237 nt1.54□□□□□ -2.16
SEC39Q12745 ALK1YGL021W 2283 nt1.54□□□□□ -2.16
SEC39Q12745 APL2YKL135C 2181 nt1.53□□□□□ -2.16
SEC39Q12745 YLR140WYLR140W 327 nt1.53□□□□□ -2.16
SEC39Q12745 YML007C-AYML007C-A 111 nt1.53□□□□□ -2.16
SEC39Q12745 HUG1YML058W-A 207 nt1.53□□□□□ -2.16
SEC39Q12745 RAD50YNL250W 3939 nt1.53□□□□□ -2.16
SEC39Q12745 SSK2YNR031C 4740 nt1.53□□□□□ -2.16
SEC39Q12745 SXM1YDR395W 2835 nt1.53□□□□□ -2.17
SEC39Q12745 INP2YMR163C 2118 nt1.52□□□□□ -2.17
SEC39Q12745 SEC5YDR166C 2916 nt1.52□□□□□ -2.17
SEC39Q12745 RPL40BYKR094C 387 nt1.52□□□□□ -2.17
SEC39Q12745 YOR199WYOR199W 330 nt1.52□□□□□ -2.17
SEC39Q12745 CDC31YOR257W 486 nt1.52□□□□□ -2.17
SEC39Q12745 TIM18YOR297C 579 nt1.52□□□□□ -2.17
SEC39Q12745 MSH3YCR092C 3057 nt1.52□□□□□ -2.17
SEC39Q12745 RIM20YOR275C 1986 nt1.52□□□□□ -2.17
SEC39Q12745 UFD2YDL190C 2886 nt1.52□□□□□ -2.17
SEC39Q12745 CAT8YMR280C 4302 nt1.52□□□□□ -2.17
SEC39Q12745 AHC1YOR023C 1701 nt1.52□□□□□ -2.17
SEC39Q12745 PIP2YOR363C 2991 nt1.51□□□□□ -2.17
SEC39Q12745 YGL217CYGL217C 342 nt1.51□□□□□ -2.17
SEC39Q12745 SDH2YLL041C 801 nt1.51□□□□□ -2.17
SEC39Q12745 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt1.51□□□□□ -2.17
SEC39Q12745 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt1.51□□□□□ -2.17
SEC39Q12745 NCA2YPR155C 1851 nt1.51□□□□□ -2.17
SEC39Q12745 YDR426CYDR426C 378 nt1.5□□□□□ -2.17
SEC39Q12745 ZIP2YGL249W 2115 nt1.5□□□□□ -2.17
SEC39Q12745 STF2YGR008C 255 nt1.5□□□□□ -2.17
SEC39Q12745 YAF9YNL107W 681 nt1.5□□□□□ -2.17
SEC39Q12745 YOR376WYOR376W 369 nt1.5□□□□□ -2.17
SEC39Q12745 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt1.5□□□□□ -2.17
SEC39Q12745 PBY1YBR094W 2262 nt1.5□□□□□ -2.17
SEC39Q12745 TRM732YMR259C 4263 nt1.49□□□□□ -2.17
SEC39Q12745 YCS4YLR272C 3531 nt1.49□□□□□ -2.17
SEC39Q12745 PIK1YNL267W 3201 nt1.49□□□□□ -2.17
SEC39Q12745 RPL35AYDL191W 363 nt1.49□□□□□ -2.17
SEC39Q12745 PCC1YKR095W-A 267 nt1.49□□□□□ -2.17
SEC39Q12745 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt1.49□□□□□ -2.17
SEC39Q12745 NOC3YLR002C 1992 nt1.48□□□□□ -2.17
SEC39Q12745 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt1.48□□□□□ -2.17
SEC39Q12745 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt1.48□□□□□ -2.17
SEC39Q12745 VPS55YJR044C 423 nt1.48□□□□□ -2.17
SEC39Q12745 MSN5YDR335W 3675 nt1.47□□□□□ -2.17
SEC39Q12745 SLX4YLR135W 2247 nt1.47□□□□□ -2.17
SEC39Q12745 YOL160WYOL160W 342 nt1.47□□□□□ -2.17
SEC39Q12745 YGR130CYGR130C 2451 nt1.47□□□□□ -2.17
SEC39Q12745 NPC2YDL046W 522 nt1.46□□□□□ -2.18
SEC39Q12745 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt1.46□□□□□ -2.18
SEC39Q12745 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt1.46□□□□□ -2.18
SEC39Q12745 EST2YLR318W 2655 nt1.46□□□□□ -2.18
SEC39Q12745 NUT1YGL151W 3399 nt1.45□□□□□ -2.18
SEC39Q12745 YIL102CYIL102C 306 nt1.45□□□□□ -2.18
SEC39Q12745 MAD1YGL086W 2250 nt1.45□□□□□ -2.18
SEC39Q12745 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.45□□□□□ -2.18
SEC39Q12745 VPS54YDR027C 2670 nt1.44□□□□□ -2.18
SEC39Q12745 SCW11YGL028C 1629 nt1.44□□□□□ -2.18
SEC39Q12745 Q0142Q0142 177 nt1.44□□□□□ -2.18
SEC39Q12745 HTB2YBL002W 396 nt1.44□□□□□ -2.18
SEC39Q12745 YPL225WYPL225W 441 nt1.44□□□□□ -2.18
SEC39Q12745 YDR102CYDR102C 333 nt1.43□□□□□ -2.18
SEC39Q12745 snR14snR14 160 nt1.43□□□□□ -2.18
SEC39Q12745 CDC36YDL165W 576 nt1.42□□□□□ -2.18
SEC39Q12745 YAR029WYAR029W 225 nt1.42□□□□□ -2.18
SEC39Q12745 YLL054CYLL054C 2532 nt1.41□□□□□ -2.18
SEC39Q12745 MDS3YGL197W 4464 nt1.41□□□□□ -2.18
SEC39Q12745 SPC98YNL126W 2541 nt1.41□□□□□ -2.18
SEC39Q12745 NIP100YPL174C 2607 nt1.41□□□□□ -2.18
SEC39Q12745 RAD34YDR314C 2079 nt1.4□□□□□ -2.19
SEC39Q12745 SLI15YBR156C 2097 nt1.4□□□□□ -2.19
SEC39Q12745 YDR048CYDR048C 315 nt1.4□□□□□ -2.19
SEC39Q12745 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.4□□□□□ -2.19
SEC39Q12745 MAM33YIL070C 801 nt1.4□□□□□ -2.19
SEC39Q12745 YJL015CYJL015C 285 nt1.4□□□□□ -2.19
SEC39Q12745 PFD1YJL179W 330 nt1.4□□□□□ -2.19
SEC39Q12745 TAR1YLR154W-C 375 nt1.4□□□□□ -2.19
SEC39Q12745 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt1.4□□□□□ -2.19
SEC39Q12745 COG4YPR105C 2586 nt1.39□□□□□ -2.19
SEC39Q12745 SEC21YNL287W 2808 nt1.39□□□□□ -2.19
SEC39Q12745 AZF1YOR113W 2745 nt1.38□□□□□ -2.19
SEC39Q12745 YDL211CYDL211C 1119 nt1.38□□□□□ -2.19
SEC39Q12745 NUP188YML103C 4968 nt1.38□□□□□ -2.19
SEC39Q12745 LCD1YDR499W 2244 nt1.38□□□□□ -2.19
SEC39Q12745 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt1.37□□□□□ -2.19
SEC39Q12745 YSY6YBR162W-A 198 nt1.37□□□□□ -2.19
SEC39Q12745 MPT5YGL178W 2580 nt1.37□□□□□ -2.19
SEC39Q12745 SPT21YMR179W 2277 nt1.36□□□□□ -2.19
SEC39Q12745 RRT15YLR162W-A 189 nt1.36□□□□□ -2.19
SEC39Q12745 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt1.36□□□□□ -2.19
SEC39Q12745 snR36snR36 182 nt1.36□□□□□ -2.19
SEC39Q12745 RSM22YKL155C 1887 nt1.35□□□□□ -2.19
SEC39Q12745 NHP2YDL208W 471 nt1.35□□□□□ -2.19
SEC39Q12745 YJR011CYJR011C 786 nt1.35□□□□□ -2.19
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