Protein–RNA interactions for Protein: P40547

VID28, Vacuolar import and degradation protein 28, yeastyeast

Predictions only

Length 921 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VID28P40547 SAS3YBL052C 2496 nt2.07□□□□□ -2.08
VID28P40547 ANS1YHR126C 480 nt2.07□□□□□ -2.08
VID28P40547 NIP100YPL174C 2607 nt2.07□□□□□ -2.08
VID28P40547 YNL028WYNL028W 318 nt2.06□□□□□ -2.08
VID28P40547 YOL160WYOL160W 342 nt2.06□□□□□ -2.08
VID28P40547 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt2.06□□□□□ -2.08
VID28P40547 FKS1YLR342W 5631 nt2.06□□□□□ -2.08
VID28P40547 MLH3YPL164C 2148 nt2.06□□□□□ -2.08
VID28P40547 HSH155YMR288W 2916 nt2.06□□□□□ -2.08
VID28P40547 SPT21YMR179W 2277 nt2.06□□□□□ -2.08
VID28P40547 MDM20YOL076W 2391 nt2.06□□□□□ -2.08
VID28P40547 UBR2YLR024C 5619 nt2.05□□□□□ -2.08
VID28P40547 PEP1YBL017C 4740 nt2.05□□□□□ -2.08
VID28P40547 SEY1YOR165W 2331 nt2.05□□□□□ -2.08
VID28P40547 SSS1YDR086C 243 nt2.04□□□□□ -2.08
VID28P40547 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt2.04□□□□□ -2.08
VID28P40547 CSE2YNR010W 450 nt2.04□□□□□ -2.08
VID28P40547 RLM1YPL089C 2031 nt2.04□□□□□ -2.08
VID28P40547 YMR045CYMR045C 5268 nt2.04□□□□□ -2.08
VID28P40547 SEC63YOR254C 1992 nt2.03□□□□□ -2.08
VID28P40547 VIK1YPL253C 1944 nt2.03□□□□□ -2.08
VID28P40547 ENV11YGR071C 2583 nt2.03□□□□□ -2.08
VID28P40547 SRP14YDL092W 441 nt2.03□□□□□ -2.08
VID28P40547 ZIP2YGL249W 2115 nt2.03□□□□□ -2.08
VID28P40547 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt2.03□□□□□ -2.09
VID28P40547 FRK1YPL141C 2598 nt2.02□□□□□ -2.09
VID28P40547 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt2.02□□□□□ -2.09
VID28P40547 YBR064WYBR064W 429 nt2.02□□□□□ -2.09
VID28P40547 APL2YKL135C 2181 nt2.02□□□□□ -2.09
VID28P40547 DGR2YKL121W 2559 nt2.02□□□□□ -2.09
VID28P40547 SPC98YNL126W 2541 nt2□□□□□ -2.09
VID28P40547 ATG9YDL149W 2994 nt2□□□□□ -2.09
VID28P40547 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt2□□□□□ -2.09
VID28P40547 RTP1YMR185W 2946 nt1.99□□□□□ -2.09
VID28P40547 YCK3YER123W 1575 nt1.99□□□□□ -2.09
VID28P40547 CDC36YDL165W 576 nt1.99□□□□□ -2.09
VID28P40547 ABF2YMR072W 552 nt1.99□□□□□ -2.09
VID28P40547 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt1.99□□□□□ -2.09
VID28P40547 LRE1YCL051W 1752 nt1.99□□□□□ -2.09
VID28P40547 MPT5YGL178W 2580 nt1.99□□□□□ -2.09
VID28P40547 MSH6YDR097C 3729 nt1.99□□□□□ -2.09
VID28P40547 HIR3YJR140C 4947 nt1.98□□□□□ -2.09
VID28P40547 PIG1YLR273C 1947 nt1.98□□□□□ -2.09
VID28P40547 snR55snR55 98 nt1.98□□□□□ -2.09
VID28P40547 snR80snR80 171 nt1.98□□□□□ -2.09
VID28P40547 INA22YIR024C 651 nt1.98□□□□□ -2.09
VID28P40547 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt1.98□□□□□ -2.09
VID28P40547 PDR8YLR266C 2106 nt1.98□□□□□ -2.09
VID28P40547 JLP2YMR132C 627 nt1.98□□□□□ -2.09
VID28P40547 HSL1YKL101W 4557 nt1.98□□□□□ -2.09
VID28P40547 MAD1YGL086W 2250 nt1.97□□□□□ -2.09
VID28P40547 YGL052WYGL052W 306 nt1.97□□□□□ -2.09
VID28P40547 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt1.97□□□□□ -2.09
VID28P40547 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt1.97□□□□□ -2.09
VID28P40547 RAD34YDR314C 2079 nt1.97□□□□□ -2.09
VID28P40547 GCN2YDR283C 4980 nt1.97□□□□□ -2.09
VID28P40547 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt1.96□□□□□ -2.1
VID28P40547 BLI1YKL061W 342 nt1.96□□□□□ -2.1
VID28P40547 IRC20YLR247C 4671 nt1.95□□□□□ -2.1
VID28P40547 PDE2YOR360C 1581 nt1.95□□□□□ -2.1
VID28P40547 RPL34BYIL052C 366 nt1.95□□□□□ -2.1
VID28P40547 YIR044CYIR044C 186 nt1.95□□□□□ -2.1
VID28P40547 MYO4YAL029C 4416 nt1.94□□□□□ -2.1
VID28P40547 MGA2YIR033W 3342 nt1.94□□□□□ -2.1
VID28P40547 YGL041CYGL041C 204 nt1.94□□□□□ -2.1
VID28P40547 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt1.94□□□□□ -2.1
VID28P40547 YMR321CYMR321C 318 nt1.94□□□□□ -2.1
VID28P40547 VPS54YDR027C 2670 nt1.94□□□□□ -2.1
VID28P40547 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt1.93□□□□□ -2.1
VID28P40547 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt1.93□□□□□ -2.1
VID28P40547 SFB2YNL049C 2631 nt1.93□□□□□ -2.1
VID28P40547 BPH1YCR032W 6504 nt1.93□□□□□ -2.1
VID28P40547 RPS27BYHR021C 249 nt1.92□□□□□ -2.1
VID28P40547 IES4YOR189W 351 nt1.92□□□□□ -2.1
VID28P40547 YOR218CYOR218C 420 nt1.92□□□□□ -2.1
VID28P40547 YNL144CYNL144C 2223 nt1.92□□□□□ -2.1
VID28P40547 CFT1YDR301W 4074 nt1.91□□□□□ -2.1
VID28P40547 SPO75YLL005C 2607 nt1.91□□□□□ -2.1
VID28P40547 UTP21YLR409C 2820 nt1.91□□□□□ -2.1
VID28P40547 GPG1YGL121C 381 nt1.91□□□□□ -2.1
VID28P40547 COA6YMR244C-A 315 nt1.91□□□□□ -2.1
VID28P40547 YOR015WYOR015W 360 nt1.91□□□□□ -2.1
VID28P40547 NOC3YLR002C 1992 nt1.9□□□□□ -2.1
VID28P40547 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt1.9□□□□□ -2.1
VID28P40547 YOR093CYOR093C 4947 nt1.9□□□□□ -2.1
VID28P40547 PAU2YEL049W 363 nt1.9□□□□□ -2.11
VID28P40547 CUL3YGR003W 2235 nt1.9□□□□□ -2.11
VID28P40547 YJR039WYJR039W 3366 nt1.9□□□□□ -2.11
VID28P40547 NUP192YJL039C 5052 nt1.89□□□□□ -2.11
VID28P40547 TRM3YDL112W 4311 nt1.89□□□□□ -2.11
VID28P40547 PTP2YOR208W 2253 nt1.88□□□□□ -2.11
VID28P40547 PAU3YCR104W 375 nt1.88□□□□□ -2.11
VID28P40547 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt1.88□□□□□ -2.11
VID28P40547 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt1.88□□□□□ -2.11
VID28P40547 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt1.87□□□□□ -2.11
VID28P40547 YHR210CYHR210C 1026 nt1.87□□□□□ -2.11
VID28P40547 RPS25BYLR333C 327 nt1.87□□□□□ -2.11
VID28P40547 MYO2YOR326W 4725 nt1.86□□□□□ -2.11
VID28P40547 YJL120WYJL120W 324 nt1.86□□□□□ -2.11
VID28P40547 TMA7YLR262C-A 195 nt1.86□□□□□ -2.11
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