Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
J3KRW8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
J3KRW8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
J3KRW8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
J3KRW8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
J3KRW8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
J3KRW8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
J3KRW8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
J3KRW8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
J3KRW8 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
J3KRW8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
J3KRW8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
J3KRW8 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
J3KRW8 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
J3KRW8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
J3KRW8 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
J3KRW8 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
J3KRW8 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
J3KRW8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
J3KRW8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
J3KRW8 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
J3KRW8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
J3KRW8 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
J3KRW8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
J3KRW8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
J3KRW8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
J3KRW8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
J3KRW8 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
J3KRW8 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
J3KRW8 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
J3KRW8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
J3KRW8 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
J3KRW8 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
J3KRW8 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
J3KRW8 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
J3KRW8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
J3KRW8 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
J3KRW8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
J3KRW8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
J3KRW8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
J3KRW8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
J3KRW8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
J3KRW8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
J3KRW8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
J3KRW8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
J3KRW8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
J3KRW8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
J3KRW8 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
J3KRW8 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
J3KRW8 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
J3KRW8 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
J3KRW8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3KRW8 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3KRW8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3KRW8 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3KRW8 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3KRW8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3KRW8 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3KRW8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3KRW8 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3KRW8 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3KRW8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3KRW8 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3KRW8 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3KRW8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3KRW8 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3KRW8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3KRW8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3KRW8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3KRW8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3KRW8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3KRW8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3KRW8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3KRW8 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3KRW8 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3KRW8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3KRW8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3KRW8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3KRW8 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3KRW8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3KRW8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3KRW8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3KRW8 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3KRW8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
J3KRW8 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3KRW8 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3KRW8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3KRW8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
J3KRW8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3KRW8 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3KRW8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
J3KRW8 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3KRW8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3KRW8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3KRW8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3KRW8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3KRW8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3KRW8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
J3KRW8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
J3KRW8 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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