Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF4Q2M2E3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF4Q2M2E3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF4Q2M2E3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF4Q2M2E3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF4Q2M2E3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF4Q2M2E3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF4Q2M2E3 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF4Q2M2E3 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF4Q2M2E3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF4Q2M2E3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ODF4Q2M2E3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODF4Q2M2E3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODF4Q2M2E3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODF4Q2M2E3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODF4Q2M2E3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODF4Q2M2E3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODF4Q2M2E3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODF4Q2M2E3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODF4Q2M2E3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODF4Q2M2E3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODF4Q2M2E3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODF4Q2M2E3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODF4Q2M2E3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODF4Q2M2E3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODF4Q2M2E3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODF4Q2M2E3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODF4Q2M2E3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODF4Q2M2E3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODF4Q2M2E3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODF4Q2M2E3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODF4Q2M2E3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODF4Q2M2E3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODF4Q2M2E3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODF4Q2M2E3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODF4Q2M2E3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODF4Q2M2E3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODF4Q2M2E3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODF4Q2M2E3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODF4Q2M2E3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODF4Q2M2E3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODF4Q2M2E3 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODF4Q2M2E3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODF4Q2M2E3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF4Q2M2E3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF4Q2M2E3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF4Q2M2E3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF4Q2M2E3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF4Q2M2E3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF4Q2M2E3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF4Q2M2E3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF4Q2M2E3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF4Q2M2E3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF4Q2M2E3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF4Q2M2E3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF4Q2M2E3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF4Q2M2E3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF4Q2M2E3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF4Q2M2E3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF4Q2M2E3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF4Q2M2E3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF4Q2M2E3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF4Q2M2E3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF4Q2M2E3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF4Q2M2E3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF4Q2M2E3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF4Q2M2E3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF4Q2M2E3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF4Q2M2E3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF4Q2M2E3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF4Q2M2E3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms