Protein–RNA interactions for Protein: Q06625

GDB1, Glycogen debranching enzyme, yeastyeast

Predictions only

Length 1,536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GDB1Q06625 MMS2YGL087C 414 nt-0.23□□□□□ -2.45
GDB1Q06625 YNR077CYNR077C 255 nt-0.23□□□□□ -2.45
GDB1Q06625 MMS4YBR098W 2076 nt-0.24□□□□□ -2.45
GDB1Q06625 GEP7YGL057C 864 nt-0.24□□□□□ -2.45
GDB1Q06625 CRG1YHR209W 876 nt-0.24□□□□□ -2.45
GDB1Q06625 PHO80YOL001W 882 nt-0.24□□□□□ -2.45
GDB1Q06625 SCW11YGL028C 1629 nt-0.24□□□□□ -2.45
GDB1Q06625 PET111YMR257C 2403 nt-0.25□□□□□ -2.45
GDB1Q06625 NOP9YJL010C 2001 nt-0.25□□□□□ -2.45
GDB1Q06625 RPL26AYLR344W 384 nt-0.25□□□□□ -2.45
GDB1Q06625 ERV15YBR210W 429 nt-0.25□□□□□ -2.45
GDB1Q06625 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt-0.26□□□□□ -2.45
GDB1Q06625 SSS1YDR086C 243 nt-0.27□□□□□ -2.45
GDB1Q06625 MET32YDR253C 576 nt-0.27□□□□□ -2.45
GDB1Q06625 AI5_BETAQ0075 1065 nt-0.27□□□□□ -2.45
GDB1Q06625 PMP1YCR024C-A 123 nt-0.28□□□□□ -2.45
GDB1Q06625 YKL115CYKL115C 393 nt-0.28□□□□□ -2.45
GDB1Q06625 YBR184WYBR184W 1572 nt-0.28□□□□□ -2.45
GDB1Q06625 BIG1YHR101C 1008 nt-0.28□□□□□ -2.45
GDB1Q06625 RPB10YOR210W 213 nt-0.28□□□□□ -2.45
GDB1Q06625 YPL080CYPL080C 327 nt-0.28□□□□□ -2.45
GDB1Q06625 YEL010WYEL010W 351 nt-0.29□□□□□ -2.46
GDB1Q06625 BET4YJL031C 984 nt-0.29□□□□□ -2.46
GDB1Q06625 YNL050CYNL050C 813 nt-0.29□□□□□ -2.46
GDB1Q06625 RPL42BYHR141C 321 nt-0.3□□□□□ -2.46
GDB1Q06625 CCE1YKL011C 1062 nt-0.3□□□□□ -2.46
GDB1Q06625 RPL42AYNL162W 321 nt-0.3□□□□□ -2.46
GDB1Q06625 PRP42YDR235W 1635 nt-0.31□□□□□ -2.46
GDB1Q06625 YBR051WYBR051W 351 nt-0.31□□□□□ -2.46
GDB1Q06625 YPR172WYPR172W 603 nt-0.31□□□□□ -2.46
GDB1Q06625 snR84snR84 550 nt-0.32□□□□□ -2.46
GDB1Q06625 YDR290WYDR290W 330 nt-0.32□□□□□ -2.46
GDB1Q06625 VMA21YGR105W 234 nt-0.32□□□□□ -2.46
GDB1Q06625 RPS27AYKL156W 249 nt-0.32□□□□□ -2.46
GDB1Q06625 SMD2YLR275W 333 nt-0.32□□□□□ -2.46
GDB1Q06625 ZIP1YDR285W 2628 nt-0.32□□□□□ -2.46
GDB1Q06625 SRP14YDL092W 441 nt-0.33□□□□□ -2.46
GDB1Q06625 RTR2YDR066C 591 nt-0.33□□□□□ -2.46
GDB1Q06625 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt-0.33□□□□□ -2.46
GDB1Q06625 RFA3YJL173C 369 nt-0.33□□□□□ -2.46
GDB1Q06625 YPR142CYPR142C 564 nt-0.33□□□□□ -2.46
GDB1Q06625 YKL136WYKL136W 399 nt-0.33□□□□□ -2.46
GDB1Q06625 YOP1YPR028W 543 nt-0.33□□□□□ -2.46
GDB1Q06625 REF2YDR195W 1602 nt-0.34□□□□□ -2.46
GDB1Q06625 ATP15YPL271W 189 nt-0.34□□□□□ -2.46
GDB1Q06625 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt-0.34□□□□□ -2.46
GDB1Q06625 KAR1YNL188W 1302 nt-0.35□□□□□ -2.46
GDB1Q06625 LCD1YDR499W 2244 nt-0.35□□□□□ -2.47
GDB1Q06625 YGR042WYGR042W 816 nt-0.35□□□□□ -2.47
GDB1Q06625 NPC2YDL046W 522 nt-0.36□□□□□ -2.47
GDB1Q06625 YLR252WYLR252W 306 nt-0.36□□□□□ -2.47
GDB1Q06625 YPL225WYPL225W 441 nt-0.36□□□□□ -2.47
GDB1Q06625 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt-0.37□□□□□ -2.47
GDB1Q06625 YJL156W-AYJL156W-A 222 nt-0.39□□□□□ -2.47
GDB1Q06625 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt-0.4□□□□□ -2.47
GDB1Q06625 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt-0.4□□□□□ -2.47
GDB1Q06625 RCO1YMR075W 2055 nt-0.41□□□□□ -2.47
GDB1Q06625 FYV10YIL097W 1551 nt-0.41□□□□□ -2.47
GDB1Q06625 YDR210WYDR210W 228 nt-0.41□□□□□ -2.48
GDB1Q06625 RRT1YBL048W 312 nt-0.41□□□□□ -2.48
GDB1Q06625 YPL197CYPL197C 414 nt-0.41□□□□□ -2.48
GDB1Q06625 YDR114CYDR114C 303 nt-0.42□□□□□ -2.48
GDB1Q06625 YBR071WYBR071W 636 nt-0.42□□□□□ -2.48
GDB1Q06625 SPO11YHL022C 1197 nt-0.43□□□□□ -2.48
GDB1Q06625 SPO23YBR250W 1572 nt-0.43□□□□□ -2.48
GDB1Q06625 NTF2YER009W 378 nt-0.43□□□□□ -2.48
GDB1Q06625 YHL042WYHL042W 453 nt-0.43□□□□□ -2.48
GDB1Q06625 PFS1YHR185C 714 nt-0.43□□□□□ -2.48
GDB1Q06625 UPS1YLR193C 528 nt-0.43□□□□□ -2.48
GDB1Q06625 YOR169CYOR169C 465 nt-0.43□□□□□ -2.48
GDB1Q06625 YBR206WYBR206W 324 nt-0.43□□□□□ -2.48
GDB1Q06625 YDL068WYDL068W 330 nt-0.45□□□□□ -2.48
GDB1Q06625 LSO2YGR169C-A 279 nt-0.45□□□□□ -2.48
GDB1Q06625 NUP82YJL061W 2142 nt-0.45□□□□□ -2.48
GDB1Q06625 HOT13YKL084W 351 nt-0.45□□□□□ -2.48
GDB1Q06625 SEC10YLR166C 2616 nt-0.46□□□□□ -2.48
GDB1Q06625 ARV1YLR242C 966 nt-0.46□□□□□ -2.48
GDB1Q06625 RAD61YDR014W 1944 nt-0.47□□□□□ -2.48
GDB1Q06625 RPL29YFR032C-A 180 nt-0.47□□□□□ -2.48
GDB1Q06625 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt-0.47□□□□□ -2.48
GDB1Q06625 YDL187CYDL187C 330 nt-0.49□□□□□ -2.49
GDB1Q06625 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt-0.49□□□□□ -2.49
GDB1Q06625 RPS16AYMR143W 432 nt-0.49□□□□□ -2.49
GDB1Q06625 YNL150WYNL150W 408 nt-0.49□□□□□ -2.49
GDB1Q06625 BI3Q0115 1554 nt-0.49□□□□□ -2.49
GDB1Q06625 YDR029WYDR029W 315 nt-0.5□□□□□ -2.49
GDB1Q06625 BSC3YLR465C 309 nt-0.5□□□□□ -2.49
GDB1Q06625 HNT1YDL125C 477 nt-0.51□□□□□ -2.49
GDB1Q06625 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt-0.51□□□□□ -2.49
GDB1Q06625 PTP2YOR208W 2253 nt-0.51□□□□□ -2.49
GDB1Q06625 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.51□□□□□ -2.49
GDB1Q06625 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt-0.53□□□□□ -2.49
GDB1Q06625 EFR3YMR212C 2349 nt-0.54□□□□□ -2.5
GDB1Q06625 SBH2YER019C-A 267 nt-0.54□□□□□ -2.5
GDB1Q06625 ORC3YLL004W 1851 nt-0.55□□□□□ -2.5
GDB1Q06625 YDL152WYDL152W 366 nt-0.55□□□□□ -2.5
GDB1Q06625 RSM18YER050C 417 nt-0.55□□□□□ -2.5
GDB1Q06625 YOL118CYOL118C 309 nt-0.55□□□□□ -2.5
GDB1Q06625 PET20YPL159C 762 nt-0.55□□□□□ -2.5
GDB1Q06625 CSM4YPL200W 471 nt-0.55□□□□□ -2.5
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 24.3 ms