Protein–RNA interactions for Protein: Q06070

YLR407W, Uncharacterized protein YLR407W, yeastyeast

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR407WQ06070 RAD61YDR014W 1944 nt2.3□□□□□ -2.04
YLR407WQ06070 UBR1YGR184C 5853 nt2.3□□□□□ -2.04
YLR407WQ06070 EMP24YGL200C 612 nt2.3□□□□□ -2.04
YLR407WQ06070 VPS8YAL002W 3825 nt2.3□□□□□ -2.04
YLR407WQ06070 SLY1YDR189W 2001 nt2.3□□□□□ -2.04
YLR407WQ06070 SGM1YJR134C 2124 nt2.3□□□□□ -2.04
YLR407WQ06070 GYP5YPL249C 2685 nt2.29□□□□□ -2.04
YLR407WQ06070 YGR250CYGR250C 2346 nt2.29□□□□□ -2.04
YLR407WQ06070 YER172C-AYER172C-A 381 nt2.29□□□□□ -2.04
YLR407WQ06070 PSD2YGR170W 3417 nt2.29□□□□□ -2.04
YLR407WQ06070 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt2.28□□□□□ -2.04
YLR407WQ06070 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt2.28□□□□□ -2.04
YLR407WQ06070 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt2.28□□□□□ -2.04
YLR407WQ06070 INP2YMR163C 2118 nt2.28□□□□□ -2.04
YLR407WQ06070 ACM1YPL267W 630 nt2.28□□□□□ -2.04
YLR407WQ06070 SSQ1YLR369W 1974 nt2.28□□□□□ -2.04
YLR407WQ06070 RFX1YLR176C 2436 nt2.28□□□□□ -2.04
YLR407WQ06070 PEP1YBL017C 4740 nt2.27□□□□□ -2.05
YLR407WQ06070 TRL1YJL087C 2484 nt2.27□□□□□ -2.05
YLR407WQ06070 YFH1YDL120W 525 nt2.27□□□□□ -2.05
YLR407WQ06070 snR49snR49 165 nt2.27□□□□□ -2.05
YLR407WQ06070 TFC8YPL007C 1767 nt2.27□□□□□ -2.05
YLR407WQ06070 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt2.26□□□□□ -2.05
YLR407WQ06070 CYB5YNL111C 363 nt2.26□□□□□ -2.05
YLR407WQ06070 MVP1YMR004W 1536 nt2.26□□□□□ -2.05
YLR407WQ06070 snR60snR60 104 nt2.25□□□□□ -2.05
YLR407WQ06070 PAU18YLL064C 363 nt2.25□□□□□ -2.05
YLR407WQ06070 JLP2YMR132C 627 nt2.25□□□□□ -2.05
YLR407WQ06070 PAU6YNR076W 363 nt2.25□□□□□ -2.05
YLR407WQ06070 CDC60YPL160W 3273 nt2.25□□□□□ -2.05
YLR407WQ06070 ARP7YPR034W 1434 nt2.25□□□□□ -2.05
YLR407WQ06070 LYS14YDR034C 2373 nt2.24□□□□□ -2.05
YLR407WQ06070 SCW11YGL028C 1629 nt2.24□□□□□ -2.05
YLR407WQ06070 CSF1YLR087C 8877 nt2.24□□□□□ -2.05
YLR407WQ06070 SIR3YLR442C 2937 nt2.24□□□□□ -2.05
YLR407WQ06070 YRB1YDR002W 606 nt2.24□□□□□ -2.05
YLR407WQ06070 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt2.24□□□□□ -2.05
YLR407WQ06070 RPB10YOR210W 213 nt2.24□□□□□ -2.05
YLR407WQ06070 PLC1YPL268W 2610 nt2.23□□□□□ -2.05
YLR407WQ06070 GIP3YPL137C 3831 nt2.23□□□□□ -2.05
YLR407WQ06070 TIM9YEL020W-A 264 nt2.23□□□□□ -2.05
YLR407WQ06070 SDH2YLL041C 801 nt2.23□□□□□ -2.05
YLR407WQ06070 YDR341CYDR341C 1824 nt2.23□□□□□ -2.05
YLR407WQ06070 MCD1YDL003W 1701 nt2.22□□□□□ -2.05
YLR407WQ06070 TRA1YHR099W 11235 nt2.22□□□□□ -2.05
YLR407WQ06070 snR80snR80 171 nt2.22□□□□□ -2.05
YLR407WQ06070 LCD1YDR499W 2244 nt2.22□□□□□ -2.05
YLR407WQ06070 KOG1YHR186C 4674 nt2.22□□□□□ -2.05
YLR407WQ06070 RTT107YHR154W 3213 nt2.21□□□□□ -2.06
YLR407WQ06070 NOP14YDL148C 2433 nt2.21□□□□□ -2.06
YLR407WQ06070 YDL118WYDL118W 381 nt2.21□□□□□ -2.06
YLR407WQ06070 YCL046WYCL046W 324 nt2.21□□□□□ -2.06
YLR407WQ06070 ZRG17YNR039C 1818 nt2.21□□□□□ -2.06
YLR407WQ06070 HCS1YKL017C 2052 nt2.21□□□□□ -2.06
YLR407WQ06070 DCP2YNL118C 2913 nt2.2□□□□□ -2.06
YLR407WQ06070 CDC36YDL165W 576 nt2.2□□□□□ -2.06
YLR407WQ06070 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt2.2□□□□□ -2.06
YLR407WQ06070 BLI1YKL061W 342 nt2.2□□□□□ -2.06
YLR407WQ06070 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt2.2□□□□□ -2.06
YLR407WQ06070 YBR064WYBR064W 429 nt2.2□□□□□ -2.06
YLR407WQ06070 PHO2YDL106C 1680 nt2.2□□□□□ -2.06
YLR407WQ06070 PET309YLR067C 2898 nt2.2□□□□□ -2.06
YLR407WQ06070 RTT101YJL047C 2529 nt2.2□□□□□ -2.06
YLR407WQ06070 NAM7YMR080C 2916 nt2.19□□□□□ -2.06
YLR407WQ06070 YJL135WYJL135W 318 nt2.19□□□□□ -2.06
YLR407WQ06070 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt2.19□□□□□ -2.06
YLR407WQ06070 ABF2YMR072W 552 nt2.19□□□□□ -2.06
YLR407WQ06070 YNL028WYNL028W 318 nt2.19□□□□□ -2.06
YLR407WQ06070 SYH1YPL105C 2550 nt2.19□□□□□ -2.06
YLR407WQ06070 MRP10YDL045W-A 288 nt2.18□□□□□ -2.06
YLR407WQ06070 YBL012CYBL012C 402 nt2.18□□□□□ -2.06
YLR407WQ06070 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt2.18□□□□□ -2.06
YLR407WQ06070 YCL023CYCL023C 348 nt2.18□□□□□ -2.06
YLR407WQ06070 YPR097WYPR097W 3222 nt2.18□□□□□ -2.06
YLR407WQ06070 IRA2YOL081W 9240 nt2.18□□□□□ -2.06
YLR407WQ06070 ZIP1YDR285W 2628 nt2.18□□□□□ -2.06
YLR407WQ06070 FKS1YLR342W 5631 nt2.17□□□□□ -2.06
YLR407WQ06070 RPL37BYDR500C 267 nt2.17□□□□□ -2.06
YLR407WQ06070 YER088C-AYER088C-A 324 nt2.17□□□□□ -2.06
YLR407WQ06070 CSE2YNR010W 450 nt2.17□□□□□ -2.06
YLR407WQ06070 MAK10YEL053C 2202 nt2.17□□□□□ -2.06
YLR407WQ06070 YLL032CYLL032C 2478 nt2.16□□□□□ -2.06
YLR407WQ06070 SPT21YMR179W 2277 nt2.16□□□□□ -2.06
YLR407WQ06070 UBP1YDL122W 2430 nt2.16□□□□□ -2.06
YLR407WQ06070 snR72snR72 98 nt2.16□□□□□ -2.06
YLR407WQ06070 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt2.16□□□□□ -2.06
YLR407WQ06070 MDM20YOL076W 2391 nt2.15□□□□□ -2.06
YLR407WQ06070 VIK1YPL253C 1944 nt2.15□□□□□ -2.06
YLR407WQ06070 snR55snR55 98 nt2.15□□□□□ -2.07
YLR407WQ06070 SSS1YDR086C 243 nt2.15□□□□□ -2.07
YLR407WQ06070 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt2.15□□□□□ -2.07
YLR407WQ06070 YNL337WYNL337W 255 nt2.15□□□□□ -2.07
YLR407WQ06070 IST2YBR086C 2841 nt2.14□□□□□ -2.07
YLR407WQ06070 YGL041CYGL041C 204 nt2.14□□□□□ -2.07
YLR407WQ06070 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt2.13□□□□□ -2.07
YLR407WQ06070 SAS3YBL052C 2496 nt2.12□□□□□ -2.07
YLR407WQ06070 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt2.12□□□□□ -2.07
YLR407WQ06070 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt2.12□□□□□ -2.07
YLR407WQ06070 YOL160WYOL160W 342 nt2.12□□□□□ -2.07
YLR407WQ06070 NIP100YPL174C 2607 nt2.11□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 147.1 ms