Protein–RNA interactions for Protein: O00515

LAD1, Ladinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAD1O00515 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAD1O00515 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAD1O00515 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAD1O00515 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAD1O00515 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAD1O00515 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAD1O00515 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAD1O00515 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAD1O00515 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAD1O00515 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAD1O00515 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LAD1O00515 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAD1O00515 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAD1O00515 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAD1O00515 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAD1O00515 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAD1O00515 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAD1O00515 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAD1O00515 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAD1O00515 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAD1O00515 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAD1O00515 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LAD1O00515 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
LAD1O00515 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LAD1O00515 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
LAD1O00515 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LAD1O00515 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAD1O00515 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAD1O00515 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAD1O00515 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAD1O00515 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAD1O00515 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAD1O00515 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAD1O00515 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAD1O00515 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAD1O00515 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAD1O00515 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAD1O00515 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAD1O00515 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAD1O00515 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAD1O00515 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAD1O00515 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAD1O00515 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LAD1O00515 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAD1O00515 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAD1O00515 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAD1O00515 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAD1O00515 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAD1O00515 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAD1O00515 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAD1O00515 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAD1O00515 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAD1O00515 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAD1O00515 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LAD1O00515 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LAD1O00515 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAD1O00515 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LAD1O00515 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LAD1O00515 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAD1O00515 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAD1O00515 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAD1O00515 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAD1O00515 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAD1O00515 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAD1O00515 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAD1O00515 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAD1O00515 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAD1O00515 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAD1O00515 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAD1O00515 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAD1O00515 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAD1O00515 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAD1O00515 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAD1O00515 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LAD1O00515 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAD1O00515 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAD1O00515 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAD1O00515 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAD1O00515 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAD1O00515 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAD1O00515 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LAD1O00515 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAD1O00515 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAD1O00515 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAD1O00515 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAD1O00515 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAD1O00515 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAD1O00515 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAD1O00515 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAD1O00515 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAD1O00515 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAD1O00515 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAD1O00515 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAD1O00515 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAD1O00515 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAD1O00515 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAD1O00515 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAD1O00515 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAD1O00515 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAD1O00515 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms