Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVZ3

NECAP2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAP2Q9NVZ3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NECAP2Q9NVZ3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms