Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCJ5

SPRYD3, SPRY domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRYD3Q8NCJ5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPRYD3Q8NCJ5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPRYD3Q8NCJ5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPRYD3Q8NCJ5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPRYD3Q8NCJ5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPRYD3Q8NCJ5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPRYD3Q8NCJ5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPRYD3Q8NCJ5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPRYD3Q8NCJ5 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPRYD3Q8NCJ5 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPRYD3Q8NCJ5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPRYD3Q8NCJ5 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPRYD3Q8NCJ5 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPRYD3Q8NCJ5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPRYD3Q8NCJ5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPRYD3Q8NCJ5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SPRYD3Q8NCJ5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPRYD3Q8NCJ5 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPRYD3Q8NCJ5 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPRYD3Q8NCJ5 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPRYD3Q8NCJ5 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPRYD3Q8NCJ5 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms