Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC62Q6P9F0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms