Protein–RNA interactions for Protein: Q03919

RUB1, NEDD8-like protein RUB1, yeastyeast

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Length 77 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RUB1Q03919 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt0.01□□□□□ -2.41
RUB1Q03919 SUP54tL(CAA)G2 82 nt0.01□□□□□ -2.41
RUB1Q03919 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt0.01□□□□□ -2.41
RUB1Q03919 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt0.01□□□□□ -2.41
RUB1Q03919 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt0.01□□□□□ -2.41
RUB1Q03919 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt0.01□□□□□ -2.41
RUB1Q03919 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt0.01□□□□□ -2.41
RUB1Q03919 TIM8YJR135W-A 264 nt0.01□□□□□ -2.41
RUB1Q03919 SPR2YOR214C 711 nt0.01□□□□□ -2.41
RUB1Q03919 IML1YJR138W 4755 nt0.01□□□□□ -2.41
RUB1Q03919 PRP5YBR237W 2550 nt0□□□□□ -2.41
RUB1Q03919 ZIP1YDR285W 2628 nt0□□□□□ -2.41
RUB1Q03919 YDR344CYDR344C 444 nt0□□□□□ -2.41
RUB1Q03919 YGL204CYGL204C 306 nt0□□□□□ -2.41
RUB1Q03919 TMA22YJR014W 597 nt0□□□□□ -2.41
RUB1Q03919 BI3Q0115 1554 nt-0.01□□□□□ -2.41
RUB1Q03919 YEL010WYEL010W 351 nt-0.01□□□□□ -2.41
RUB1Q03919 LSM12YHR121W 564 nt-0.01□□□□□ -2.41
RUB1Q03919 COX12YLR038C 252 nt-0.01□□□□□ -2.41
RUB1Q03919 HTD2YHR067W 843 nt-0.02□□□□□ -2.41
RUB1Q03919 URM1YIL008W 300 nt-0.02□□□□□ -2.41
RUB1Q03919 HIT1YJR055W 495 nt-0.02□□□□□ -2.41
RUB1Q03919 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt-0.02□□□□□ -2.41
RUB1Q03919 YPR153WYPR153W 423 nt-0.02□□□□□ -2.41
RUB1Q03919 YCL023CYCL023C 348 nt-0.02□□□□□ -2.41
RUB1Q03919 MET32YDR253C 576 nt-0.03□□□□□ -2.41
RUB1Q03919 MMS21YEL019C 804 nt-0.03□□□□□ -2.41
RUB1Q03919 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt-0.03□□□□□ -2.41
RUB1Q03919 GSP1YLR293C 660 nt-0.03□□□□□ -2.41
RUB1Q03919 RCN2YOR220W 798 nt-0.03□□□□□ -2.41
RUB1Q03919 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt-0.04□□□□□ -2.42
RUB1Q03919 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt-0.04□□□□□ -2.42
RUB1Q03919 YOR053WYOR053W 342 nt-0.04□□□□□ -2.42
RUB1Q03919 YPR172WYPR172W 603 nt-0.04□□□□□ -2.42
RUB1Q03919 ICS2YBR157C 768 nt-0.04□□□□□ -2.42
RUB1Q03919 MMS4YBR098W 2076 nt-0.04□□□□□ -2.42
RUB1Q03919 LCD1YDR499W 2244 nt-0.05□□□□□ -2.42
RUB1Q03919 UTP20YBL004W 7482 nt-0.05□□□□□ -2.42
RUB1Q03919 YOR218CYOR218C 420 nt-0.05□□□□□ -2.42
RUB1Q03919 IRC13YOR235W 315 nt-0.05□□□□□ -2.42
RUB1Q03919 snR190snR190 190 nt-0.05□□□□□ -2.42
RUB1Q03919 VIK1YPL253C 1944 nt-0.05□□□□□ -2.42
RUB1Q03919 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt-0.06□□□□□ -2.42
RUB1Q03919 UBC9YDL064W 474 nt-0.06□□□□□ -2.42
RUB1Q03919 YDL068WYDL068W 330 nt-0.06□□□□□ -2.42
RUB1Q03919 NTF2YER009W 378 nt-0.06□□□□□ -2.42
RUB1Q03919 RPL29YFR032C-A 180 nt-0.06□□□□□ -2.42
RUB1Q03919 UPS1YLR193C 528 nt-0.06□□□□□ -2.42
RUB1Q03919 COX7YMR256C 183 nt-0.06□□□□□ -2.42
RUB1Q03919 YOR282WYOR282W 321 nt-0.06□□□□□ -2.42
RUB1Q03919 ALY2YJL084C 3141 nt-0.07□□□□□ -2.42
RUB1Q03919 snR84snR84 550 nt-0.07□□□□□ -2.42
RUB1Q03919 YFR057WYFR057W 456 nt-0.07□□□□□ -2.42
RUB1Q03919 OST5YGL226C-A 261 nt-0.07□□□□□ -2.42
RUB1Q03919 TIM10YHR005C-A 282 nt-0.07□□□□□ -2.42
RUB1Q03919 YLR232WYLR232W 348 nt-0.07□□□□□ -2.42
RUB1Q03919 ATP20YPR020W 348 nt-0.07□□□□□ -2.42
RUB1Q03919 PET111YMR257C 2403 nt-0.07□□□□□ -2.42
RUB1Q03919 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt-0.08□□□□□ -2.42
RUB1Q03919 YHL037CYHL037C 402 nt-0.08□□□□□ -2.42
RUB1Q03919 BIG1YHR101C 1008 nt-0.08□□□□□ -2.42
RUB1Q03919 NCS2YNL119W 1482 nt-0.09□□□□□ -2.42
RUB1Q03919 SLY1YDR189W 2001 nt-0.09□□□□□ -2.42
RUB1Q03919 THG1YGR024C 714 nt-0.09□□□□□ -2.42
RUB1Q03919 VMA21YGR105W 234 nt-0.09□□□□□ -2.42
RUB1Q03919 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt-0.09□□□□□ -2.42
RUB1Q03919 LOA1YPR139C 903 nt-0.09□□□□□ -2.42
RUB1Q03919 MLP2YIL149C 5040 nt-0.09□□□□□ -2.42
RUB1Q03919 GUP1YGL084C 1683 nt-0.1□□□□□ -2.43
RUB1Q03919 snR79snR79 84 nt-0.1□□□□□ -2.43
RUB1Q03919 RMD6YEL072W 696 nt-0.1□□□□□ -2.43
RUB1Q03919 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt-0.1□□□□□ -2.43
RUB1Q03919 YLR163W-AYLR163W-A 114 nt-0.1□□□□□ -2.43
RUB1Q03919 UBX4YMR067C 1251 nt-0.1□□□□□ -2.43
RUB1Q03919 CDC33YOL139C 642 nt-0.1□□□□□ -2.43
RUB1Q03919 YAR009CYAR009C 3591 nt-0.11□□□□□ -2.43
RUB1Q03919 PMP1YCR024C-A 123 nt-0.11□□□□□ -2.43
RUB1Q03919 SSS1YDR086C 243 nt-0.11□□□□□ -2.43
RUB1Q03919 RSM18YER050C 417 nt-0.11□□□□□ -2.43
RUB1Q03919 RPL9AYGL147C 576 nt-0.11□□□□□ -2.43
RUB1Q03919 ARV1YLR242C 966 nt-0.11□□□□□ -2.43
RUB1Q03919 SPC24YMR117C 642 nt-0.11□□□□□ -2.43
RUB1Q03919 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt-0.11□□□□□ -2.43
RUB1Q03919 ORC3YLL004W 1851 nt-0.12□□□□□ -2.43
RUB1Q03919 MLP1YKR095W 5628 nt-0.12□□□□□ -2.43
RUB1Q03919 NOP9YJL010C 2001 nt-0.12□□□□□ -2.43
RUB1Q03919 YDR115WYDR115W 318 nt-0.12□□□□□ -2.43
RUB1Q03919 YEL057CYEL057C 702 nt-0.12□□□□□ -2.43
RUB1Q03919 YER038W-AYER038W-A 381 nt-0.12□□□□□ -2.43
RUB1Q03919 YFR032C-BYFR032C-B 264 nt-0.12□□□□□ -2.43
RUB1Q03919 YLR252WYLR252W 306 nt-0.12□□□□□ -2.43
RUB1Q03919 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt-0.12□□□□□ -2.43
RUB1Q03919 YMR158C-AYMR158C-A 138 nt-0.12□□□□□ -2.43
RUB1Q03919 PAI3YMR174C 207 nt-0.12□□□□□ -2.43
RUB1Q03919 RRT1YBL048W 312 nt-0.12□□□□□ -2.43
RUB1Q03919 YBL108WYBL108W 306 nt-0.12□□□□□ -2.43
RUB1Q03919 snR44snR44 211 nt-0.12□□□□□ -2.43
RUB1Q03919 SPO23YBR250W 1572 nt-0.13□□□□□ -2.43
RUB1Q03919 YER023C-AYER023C-A 213 nt-0.13□□□□□ -2.43
RUB1Q03919 RPL32YBL092W 393 nt-0.13□□□□□ -2.43
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