Protein–RNA interactions for Protein: P53628

SNF12, Transcription regulatory protein SNF12, yeastyeast

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNF12P53628 ACB1YGR037C 264 nt2.39□□□□□ -2.03
SNF12P53628 SMD1YGR074W 441 nt2.39□□□□□ -2.03
SNF12P53628 YML007C-AYML007C-A 111 nt2.39□□□□□ -2.03
SNF12P53628 YOR055WYOR055W 435 nt2.39□□□□□ -2.03
SNF12P53628 HHT1YBR010W 411 nt2.39□□□□□ -2.03
SNF12P53628 YBR224WYBR224W 516 nt2.39□□□□□ -2.03
SNF12P53628 YBR277CYBR277C 402 nt2.39□□□□□ -2.03
SNF12P53628 VPS13YLL040C 9435 nt2.39□□□□□ -2.03
SNF12P53628 YEL043WYEL043W 2871 nt2.39□□□□□ -2.03
SNF12P53628 RGA2YDR379W 3030 nt2.39□□□□□ -2.03
SNF12P53628 RIC1YLR039C 3171 nt2.39□□□□□ -2.03
SNF12P53628 YDR426CYDR426C 378 nt2.38□□□□□ -2.03
SNF12P53628 PRE4YFR050C 801 nt2.38□□□□□ -2.03
SNF12P53628 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt2.38□□□□□ -2.03
SNF12P53628 YGR250CYGR250C 2346 nt2.38□□□□□ -2.03
SNF12P53628 EFR3YMR212C 2349 nt2.38□□□□□ -2.03
SNF12P53628 SEF1YBL066C 3447 nt2.38□□□□□ -2.03
SNF12P53628 YEF3YLR249W 3135 nt2.37□□□□□ -2.03
SNF12P53628 CSF1YLR087C 8877 nt2.37□□□□□ -2.03
SNF12P53628 snR60snR60 104 nt2.37□□□□□ -2.03
SNF12P53628 RPA34YJL148W 702 nt2.37□□□□□ -2.03
SNF12P53628 RPL38YLR325C 237 nt2.37□□□□□ -2.03
SNF12P53628 YNL198CYNL198C 303 nt2.37□□□□□ -2.03
SNF12P53628 YBR064WYBR064W 429 nt2.37□□□□□ -2.03
SNF12P53628 AFI1YOR129C 2682 nt2.37□□□□□ -2.03
SNF12P53628 RPO41YFL036W 4056 nt2.37□□□□□ -2.03
SNF12P53628 GIS1YDR096W 2685 nt2.36□□□□□ -2.03
SNF12P53628 snR55snR55 98 nt2.36□□□□□ -2.03
SNF12P53628 MCD1YDL003W 1701 nt2.36□□□□□ -2.03
SNF12P53628 PEP3YLR148W 2757 nt2.36□□□□□ -2.03
SNF12P53628 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.36□□□□□ -2.03
SNF12P53628 PDR1YGL013C 3207 nt2.36□□□□□ -2.03
SNF12P53628 CRM1YGR218W 3255 nt2.36□□□□□ -2.03
SNF12P53628 YOL098CYOL098C 3114 nt2.35□□□□□ -2.03
SNF12P53628 SNC1YAL030W 354 nt2.35□□□□□ -2.03
SNF12P53628 YPR063CYPR063C 423 nt2.35□□□□□ -2.03
SNF12P53628 GRR1YJR090C 3456 nt2.35□□□□□ -2.03
SNF12P53628 CBF2YGR140W 2871 nt2.35□□□□□ -2.03
SNF12P53628 YLR149CYLR149C 2193 nt2.34□□□□□ -2.03
SNF12P53628 SVL3YPL032C 2478 nt2.34□□□□□ -2.03
SNF12P53628 MNL2YLR057W 2550 nt2.34□□□□□ -2.03
SNF12P53628 VPS34YLR240W 2628 nt2.34□□□□□ -2.03
SNF12P53628 PAU8YAL068C 363 nt2.34□□□□□ -2.03
SNF12P53628 UPS1YLR193C 528 nt2.34□□□□□ -2.03
SNF12P53628 PAU20YOL161C 363 nt2.34□□□□□ -2.03
SNF12P53628 NUT2YPR168W 474 nt2.34□□□□□ -2.03
SNF12P53628 YCK3YER123W 1575 nt2.33□□□□□ -2.04
SNF12P53628 CDC27YBL084C 2277 nt2.33□□□□□ -2.04
SNF12P53628 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.33□□□□□ -2.04
SNF12P53628 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.33□□□□□ -2.04
SNF12P53628 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.33□□□□□ -2.04
SNF12P53628 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.33□□□□□ -2.04
SNF12P53628 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.33□□□□□ -2.04
SNF12P53628 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.33□□□□□ -2.04
SNF12P53628 CYB5YNL111C 363 nt2.33□□□□□ -2.04
SNF12P53628 NEW1YPL226W 3591 nt2.33□□□□□ -2.04
SNF12P53628 STE11YLR362W 2154 nt2.33□□□□□ -2.04
SNF12P53628 CFT2YLR115W 2580 nt2.33□□□□□ -2.04
SNF12P53628 SCH9YHR205W 2475 nt2.32□□□□□ -2.04
SNF12P53628 YLR294CYLR294C 330 nt2.32□□□□□ -2.04
SNF12P53628 YOR333CYOR333C 417 nt2.32□□□□□ -2.04
SNF12P53628 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt2.32□□□□□ -2.04
SNF12P53628 TOR1YJR066W 7413 nt2.32□□□□□ -2.04
SNF12P53628 RPL42BYHR141C 321 nt2.31□□□□□ -2.04
SNF12P53628 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt2.31□□□□□ -2.04
SNF12P53628 RPL42AYNL162W 321 nt2.31□□□□□ -2.04
SNF12P53628 IES4YOR189W 351 nt2.31□□□□□ -2.04
SNF12P53628 MVP1YMR004W 1536 nt2.31□□□□□ -2.04
SNF12P53628 VMR1YHL035C 4779 nt2.31□□□□□ -2.04
SNF12P53628 SCW11YGL028C 1629 nt2.31□□□□□ -2.04
SNF12P53628 RAV1YJR033C 4074 nt2.31□□□□□ -2.04
SNF12P53628 FKS3YMR306W 5358 nt2.31□□□□□ -2.04
SNF12P53628 SWI6YLR182W 2412 nt2.3□□□□□ -2.04
SNF12P53628 RPS17AYML024W 411 nt2.3□□□□□ -2.04
SNF12P53628 NOP53YPL146C 1368 nt2.3□□□□□ -2.04
SNF12P53628 PHO91YNR013C 2685 nt2.3□□□□□ -2.04
SNF12P53628 DNA2YHR164C 4569 nt2.29□□□□□ -2.04
SNF12P53628 IRA2YOL081W 9240 nt2.29□□□□□ -2.04
SNF12P53628 ISD11YER048W-A 285 nt2.29□□□□□ -2.04
SNF12P53628 APQ12YIL040W 417 nt2.29□□□□□ -2.04
SNF12P53628 EMC6YLL014W 327 nt2.29□□□□□ -2.04
SNF12P53628 YCL023CYCL023C 348 nt2.29□□□□□ -2.04
SNF12P53628 SSQ1YLR369W 1974 nt2.29□□□□□ -2.04
SNF12P53628 GPG1YGL121C 381 nt2.28□□□□□ -2.04
SNF12P53628 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.28□□□□□ -2.04
SNF12P53628 TRX1YLR043C 312 nt2.28□□□□□ -2.04
SNF12P53628 YNL028WYNL028W 318 nt2.28□□□□□ -2.04
SNF12P53628 YBL083CYBL083C 426 nt2.28□□□□□ -2.04
SNF12P53628 UBR1YGR184C 5853 nt2.28□□□□□ -2.04
SNF12P53628 PTP3YER075C 2787 nt2.27□□□□□ -2.05
SNF12P53628 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.27□□□□□ -2.05
SNF12P53628 PAM16YJL104W 450 nt2.27□□□□□ -2.05
SNF12P53628 PFD1YJL179W 330 nt2.27□□□□□ -2.05
SNF12P53628 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt2.27□□□□□ -2.05
SNF12P53628 YLR255CYLR255C 354 nt2.27□□□□□ -2.05
SNF12P53628 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt2.27□□□□□ -2.05
SNF12P53628 NUP120YKL057C 3114 nt2.26□□□□□ -2.05
SNF12P53628 PAU2YEL049W 363 nt2.26□□□□□ -2.05
SNF12P53628 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.26□□□□□ -2.05
SNF12P53628 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt2.26□□□□□ -2.05
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