Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARFGEF2Q9Y6D5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms