RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000251303.10

SLX1A-201, Transcript of SLX1 homolog A, structure-specific endonuclease subunit, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLX1A, Length 1,091 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX1A-201ENST00000251303 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.32■■■■■ 5.33
SLX1A-201ENST00000251303 ABCC9O60706 1549 aa43.78■■■■■ 4.6
SLX1A-201ENST00000251303 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.56■■■■■ 4.56
SLX1A-201ENST00000251303 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.58■■■■■ 4.25
SLX1A-201ENST00000251303 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.34■■■■■ 4.21
SLX1A-201ENST00000251303 NACADO15069 1562 aa41.22■■■■■ 4.19
SLX1A-201ENST00000251303 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.77■■■■■ 4.12
SLX1A-201ENST00000251303 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.67■■■■■ 4.1
SLX1A-201ENST00000251303 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.66■■■■■ 4.1
SLX1A-201ENST00000251303 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.58■■■■■ 4.09
SLX1A-201ENST00000251303 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.41■■■■■ 4.06
SLX1A-201ENST00000251303 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40■■■■□ 3.99
SLX1A-201ENST00000251303 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.93■■■■□ 3.98
SLX1A-201ENST00000251303 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.86■■■■□ 3.97
SLX1A-201ENST00000251303 SCRIBQ14160 1630 aa39.62■■■■□ 3.93
SLX1A-201ENST00000251303 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.58■■■■□ 3.93
SLX1A-201ENST00000251303 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.49■■■■□ 3.91
SLX1A-201ENST00000251303 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.42■■■■□ 3.9
SLX1A-201ENST00000251303 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.2■■■■□ 3.71
SLX1A-201ENST00000251303 NCAPD3P42695 1498 aa38.05■■■■□ 3.68
SLX1A-201ENST00000251303 CUX2O14529 1486 aa37.91■■■■□ 3.66
SLX1A-201ENST00000251303 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.88■■■■□ 3.65
SLX1A-201ENST00000251303 ERCC6Q03468 1493 aa37.83■■■■□ 3.65
SLX1A-201ENST00000251303 SMARCA4P51532 1647 aa37.79■■■■□ 3.64
SLX1A-201ENST00000251303 HMGXB3Q12766 1538 aa37.77■■■■□ 3.64
SLX1A-201ENST00000251303 SMARCA2P51531 1590 aa37.77■■■■□ 3.64
SLX1A-201ENST00000251303 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.54■■■■□ 3.6
SLX1A-201ENST00000251303 NESP48681 1621 aa37.54■■■■□ 3.6
SLX1A-201ENST00000251303 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.49■■■■□ 3.59
SLX1A-201ENST00000251303 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.45■■■■□ 3.59
SLX1A-201ENST00000251303 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.29■■■■□ 3.56
SLX1A-201ENST00000251303 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.26■■■■□ 3.56
SLX1A-201ENST00000251303 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.23■■■■□ 3.55
SLX1A-201ENST00000251303 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.09■■■■□ 3.53
SLX1A-201ENST00000251303 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.01■■■■□ 3.51
SLX1A-201ENST00000251303 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.85■■■■□ 3.49
SLX1A-201ENST00000251303 WIZO95785 1651 aa36.77■■■■□ 3.48
SLX1A-201ENST00000251303 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.74■■■■□ 3.47
SLX1A-201ENST00000251303 WDR62O43379 1518 aa36.69■■■■□ 3.46
SLX1A-201ENST00000251303 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.52■■■■□ 3.44
SLX1A-201ENST00000251303 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.44■■■■□ 3.42
SLX1A-201ENST00000251303 CFTRP13569 1480 aa36.39■■■■□ 3.42
SLX1A-201ENST00000251303 TRIM41Q8WV44 630 aa36.34■■■■□ 3.41
SLX1A-201ENST00000251303 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.33■■■■□ 3.41
SLX1A-201ENST00000251303 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.3■■■■□ 3.4
SLX1A-201ENST00000251303 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.18■■■■□ 3.38
SLX1A-201ENST00000251303 PRDM2Q13029 1718 aa36.05■■■■□ 3.36
SLX1A-201ENST00000251303 OSCARQ8IYS5 282 aa36.04■■■■□ 3.36
SLX1A-201ENST00000251303 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.86■■■■□ 3.33
SLX1A-201ENST00000251303 IFT140Q96RY7 1462 aa35.8■■■■□ 3.32
SLX1A-201ENST00000251303 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.78■■■■□ 3.32
SLX1A-201ENST00000251303 TOPBP1Q92547 1522 aa35.73■■■■□ 3.31
SLX1A-201ENST00000251303 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.7■■■■□ 3.31
SLX1A-201ENST00000251303 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.7■■■■□ 3.31
SLX1A-201ENST00000251303 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.7■■■■□ 3.31
SLX1A-201ENST00000251303 ABCC8Q09428 1581 aa35.62■■■■□ 3.29
SLX1A-201ENST00000251303 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.6■■■■□ 3.29
SLX1A-201ENST00000251303 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.59■■■■□ 3.29
SLX1A-201ENST00000251303 ARHGEF11O15085 1522 aa35.54■■■■□ 3.28
SLX1A-201ENST00000251303 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.46■■■■□ 3.27
SLX1A-201ENST00000251303 CHD1O14646 1710 aa35.39■■■■□ 3.26
SLX1A-201ENST00000251303 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.38■■■■□ 3.257e-13■■■■□ 23.3
SLX1A-201ENST00000251303 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.35■■■■□ 3.25
SLX1A-201ENST00000251303 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.21■■■■□ 3.23
SLX1A-201ENST00000251303 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.2■■■■□ 3.23
SLX1A-201ENST00000251303 ARAP1Q96P48 1450 aa35.17■■■■□ 3.22
SLX1A-201ENST00000251303 FBLN2P98095 1184 aa35.15■■■■□ 3.22
SLX1A-201ENST00000251303 SOGA1O94964 1423 aa35.14■■■■□ 3.22
SLX1A-201ENST00000251303 WDR97A6NE52 1622 aa35.1■■■■□ 3.21
SLX1A-201ENST00000251303 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.1■■■■□ 3.21
SLX1A-201ENST00000251303 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.08■■■■□ 3.21
SLX1A-201ENST00000251303 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.04■■■■□ 3.2
SLX1A-201ENST00000251303 CUX1P39880 1505 aa35.01■■■■□ 3.19
SLX1A-201ENST00000251303 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.99■■■■□ 3.19
SLX1A-201ENST00000251303 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.96■■■■□ 3.19
SLX1A-201ENST00000251303 SYNJ1O43426 1573 aa34.91■■■■□ 3.18
SLX1A-201ENST00000251303 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.91■■■■□ 3.18
SLX1A-201ENST00000251303 GRIN2BQ13224 1484 aa34.9■■■■□ 3.18
SLX1A-201ENST00000251303 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.86■■■■□ 3.17
SLX1A-201ENST00000251303 SYNJ2O15056 1496 aa34.84■■■■□ 3.17
SLX1A-201ENST00000251303 PBRM1Q86U86 1689 aa34.79■■■■□ 3.16
SLX1A-201ENST00000251303 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.72■■■■□ 3.15
SLX1A-201ENST00000251303 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.68■■■■□ 3.14
SLX1A-201ENST00000251303 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.67■■■■□ 3.14
SLX1A-201ENST00000251303 GRIN2AQ12879 1464 aa34.46■■■■□ 3.11
SLX1A-201ENST00000251303 ADAMTS12P58397 1594 aa34.44■■■■□ 3.1
SLX1A-201ENST00000251303 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.43■■■■□ 3.1
SLX1A-201ENST00000251303 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.4■■■■□ 3.1
SLX1A-201ENST00000251303 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.39■■■■□ 3.1
SLX1A-201ENST00000251303 NUP160Q12769 1436 aa34.38■■■■□ 3.09
SLX1A-201ENST00000251303 CEP170Q5SW79 1584 aa34.37■■■■□ 3.09
SLX1A-201ENST00000251303 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.37■■■■□ 3.09
SLX1A-201ENST00000251303 TOP2BQ02880 1626 aa34.37■■■■□ 3.09
SLX1A-201ENST00000251303 SHROOM2Q13796 1616 aa34.29■■■■□ 3.08
SLX1A-201ENST00000251303 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.28■■■■□ 3.08
SLX1A-201ENST00000251303 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.24■■■■□ 3.07
SLX1A-201ENST00000251303 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP34.12■■■■□ 3.05
SLX1A-201ENST00000251303 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.03■■■■□ 3.04
SLX1A-201ENST00000251303 KIF13AQ9H1H9 1805 aa33.99■■■■□ 3.03
SLX1A-201ENST00000251303 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.97■■■■□ 3.03
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