Protein–RNA interactions for Protein: Q13595

TRA2A, Transformer-2 protein homolog alpha, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2AQ13595 SEM1-214ENST00000613919 610 ntTSL 29.01□□□□□ -0.976e-18■□□□□ 10
TRA2AQ13595 SEM1-210ENST00000488005 775 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.976e-18■□□□□ 10
TRA2AQ13595 SEM1-203ENST00000413065 661 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.046e-18■□□□□ 10
TRA2AQ13595 SEM1-223ENST00000623498 582 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.056e-18■□□□□ 10
TRA2AQ13595 SEM1-224ENST00000623693 729 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.116e-18■□□□□ 10
TRA2AQ13595 SEM1-207ENST00000466986 507 ntTSL 27.51□□□□□ -1.216e-18■□□□□ 10
TRA2AQ13595 SEM1-219ENST00000618105 544 ntTSL 25.5□□□□□ -1.536e-18■□□□□ 10
TRA2AQ13595 SEM1-217ENST00000617133 591 ntTSL 24.02□□□□□ -1.776e-18■□□□□ 10
TRA2AQ13595 SEM1-220ENST00000619259 462 ntTSL 23.81□□□□□ -1.86e-18■□□□□ 10
TRA2AQ13595 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.116e-7■□□□□ 10
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TRA2AQ13595 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.346e-7■□□□□ 10
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TRA2AQ13595 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.386e-7■□□□□ 10
TRA2AQ13595 UBE2V1-203ENST00000371674 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.666e-7■□□□□ 10
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TRA2AQ13595 CBFA2T3-211ENST00000570046 284 ntTSL 39.52□□□□□ -0.896e-7■□□□□ 10
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TRA2AQ13595 GOLGA2-201ENST00000421699 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.855e-9■□□□□ 9.9
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TRA2AQ13595 VEGFA-218ENST00000518689 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.452e-8■□□□□ 9.9
TRA2AQ13595 VEGFA-223ENST00000523125 541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.452e-8■□□□□ 9.9
TRA2AQ13595 PDXDC2P-NPIPB14P-204ENST00000530079 2764 ntTSL 512.18□□□□□ -0.467e-7■□□□□ 9.9
TRA2AQ13595 PDXDC2P-NPIPB14P-203ENST00000529089 1580 ntTSL 211.32□□□□□ -0.67e-7■□□□□ 9.9
TRA2AQ13595 VEGFA-215ENST00000497139 2746 ntTSL 1 (best)11.29□□□□□ -0.62e-8■□□□□ 9.9
TRA2AQ13595 PNN-203ENST00000554117 624 ntTSL 210.71□□□□□ -0.698e-10■□□□□ 9.9
TRA2AQ13595 PDXDC2P-NPIPB14P-205ENST00000531894 4184 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.77e-7■□□□□ 9.9
TRA2AQ13595 SPTBN1-202ENST00000356805 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.87e-7■□□□□ 9.9
TRA2AQ13595 CDV3-202ENST00000420115 3621 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.917e-7■□□□□ 9.9
TRA2AQ13595 SPTBN1-201ENST00000333896 9075 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -17e-7■□□□□ 9.9
TRA2AQ13595 VEGFA-212ENST00000480614 12167 ntTSL 1 (best)8.61□□□□□ -1.032e-8■□□□□ 9.9
TRA2AQ13595 NKD1-201ENST00000268459 17105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.062e-8■□□□□ 9.9
TRA2AQ13595 SPTBN1-207ENST00000615901 10226 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.087e-7■□□□□ 9.9
TRA2AQ13595 CDV3-209ENST00000515421 1305 ntTSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.127e-7■□□□□ 9.9
TRA2AQ13595 VEGFA-214ENST00000493786 551 ntTSL 27.35□□□□□ -1.232e-8■□□□□ 9.9
TRA2AQ13595 PDXDC2P-205ENST00000534580 566 ntTSL 47.08□□□□□ -1.287e-7■□□□□ 9.9
TRA2AQ13595 CDV3-206ENST00000507408 448 ntTSL 26.91□□□□□ -1.37e-7■□□□□ 9.9
TRA2AQ13595 PDXDC2P-204ENST00000533264 564 ntTSL 46.24□□□□□ -1.417e-7■□□□□ 9.9
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