Protein–RNA interactions for Protein: Q12246

LCB4, Sphingoid long chain base kinase 4, yeastyeast

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LCB4Q12246 ACB1YGR037C 264 nt2.37□□□□□ -2.03
LCB4Q12246 RPS27AYKL156W 249 nt2.37□□□□□ -2.03
LCB4Q12246 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt2.37□□□□□ -2.03
LCB4Q12246 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt2.37□□□□□ -2.03
LCB4Q12246 SNC2YOR327C 348 nt2.37□□□□□ -2.03
LCB4Q12246 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt2.37□□□□□ -2.03
LCB4Q12246 TAE2YPL009C 3117 nt2.37□□□□□ -2.03
LCB4Q12246 SCD5YOR329C 2619 nt2.37□□□□□ -2.03
LCB4Q12246 NUP170YBL079W 4509 nt2.36□□□□□ -2.03
LCB4Q12246 SWR1YDR334W 4545 nt2.36□□□□□ -2.03
LCB4Q12246 MRPL33YMR286W 261 nt2.36□□□□□ -2.03
LCB4Q12246 KTI11YBL071W-A 249 nt2.36□□□□□ -2.03
LCB4Q12246 YBR277CYBR277C 402 nt2.36□□□□□ -2.03
LCB4Q12246 SAP190YKR028W 3102 nt2.36□□□□□ -2.03
LCB4Q12246 VPS35YJL154C 2835 nt2.36□□□□□ -2.03
LCB4Q12246 MLH1YMR167W 2310 nt2.35□□□□□ -2.03
LCB4Q12246 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt2.35□□□□□ -2.03
LCB4Q12246 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt2.35□□□□□ -2.03
LCB4Q12246 NOP10YHR072W-A 177 nt2.35□□□□□ -2.03
LCB4Q12246 RPL32YBL092W 393 nt2.35□□□□□ -2.03
LCB4Q12246 YPR099CYPR099C 357 nt2.35□□□□□ -2.03
LCB4Q12246 RGA2YDR379W 3030 nt2.35□□□□□ -2.03
LCB4Q12246 DIS3YOL021C 3006 nt2.35□□□□□ -2.03
LCB4Q12246 HOS4YIL112W 3252 nt2.35□□□□□ -2.03
LCB4Q12246 PAC1YOR269W 1485 nt2.34□□□□□ -2.03
LCB4Q12246 YEF3YLR249W 3135 nt2.34□□□□□ -2.03
LCB4Q12246 PDR11YIL013C 4236 nt2.34□□□□□ -2.03
LCB4Q12246 RBK1YCR036W 1002 nt2.34□□□□□ -2.03
LCB4Q12246 YGR050CYGR050C 357 nt2.34□□□□□ -2.03
LCB4Q12246 SMD1YGR074W 441 nt2.34□□□□□ -2.03
LCB4Q12246 PHS1YJL097W 654 nt2.34□□□□□ -2.03
LCB4Q12246 SPF1YEL031W 3648 nt2.34□□□□□ -2.04
LCB4Q12246 TRS130YMR218C 3309 nt2.34□□□□□ -2.04
LCB4Q12246 RPL35AYDL191W 363 nt2.33□□□□□ -2.04
LCB4Q12246 CSN9YDR179C 489 nt2.33□□□□□ -2.04
LCB4Q12246 GCN4YEL009C 846 nt2.33□□□□□ -2.04
LCB4Q12246 YFL063WYFL063W 456 nt2.33□□□□□ -2.04
LCB4Q12246 YMR320WYMR320W 306 nt2.33□□□□□ -2.04
LCB4Q12246 AMS1YGL156W 3252 nt2.33□□□□□ -2.04
LCB4Q12246 RRP6YOR001W 2202 nt2.33□□□□□ -2.04
LCB4Q12246 INP53YOR109W 3324 nt2.32□□□□□ -2.04
LCB4Q12246 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt2.32□□□□□ -2.04
LCB4Q12246 YDR239CYDR239C 2364 nt2.32□□□□□ -2.04
LCB4Q12246 SVL3YPL032C 2478 nt2.32□□□□□ -2.04
LCB4Q12246 TOP2YNL088W 4287 nt2.32□□□□□ -2.04
LCB4Q12246 INP51YIL002C 2841 nt2.32□□□□□ -2.04
LCB4Q12246 STH1YIL126W 4080 nt2.31□□□□□ -2.04
LCB4Q12246 PUT3YKL015W 2940 nt2.31□□□□□ -2.04
LCB4Q12246 snR8snR8 190 nt2.31□□□□□ -2.04
LCB4Q12246 HYP2YEL034W 474 nt2.31□□□□□ -2.04
LCB4Q12246 YGL069CYGL069C 465 nt2.31□□□□□ -2.04
LCB4Q12246 YLR255CYLR255C 354 nt2.31□□□□□ -2.04
LCB4Q12246 LYS9YNR050C 1341 nt2.31□□□□□ -2.04
LCB4Q12246 KAP123YER110C 3342 nt2.31□□□□□ -2.04
LCB4Q12246 YIL080WYIL080W 4722 nt2.31□□□□□ -2.04
LCB4Q12246 PAN3YKL025C 2040 nt2.3□□□□□ -2.04
LCB4Q12246 HMRA2YCR096C 360 nt2.3□□□□□ -2.04
LCB4Q12246 YGL149WYGL149W 306 nt2.3□□□□□ -2.04
LCB4Q12246 SNC1YAL030W 354 nt2.3□□□□□ -2.04
LCB4Q12246 TAR1YLR154W-C 375 nt2.3□□□□□ -2.04
LCB4Q12246 SSQ1YLR369W 1974 nt2.3□□□□□ -2.04
LCB4Q12246 HSC82YMR186W 2118 nt2.3□□□□□ -2.04
LCB4Q12246 TOF2YKR010C 2316 nt2.29□□□□□ -2.04
LCB4Q12246 CLN3YAL040C 1743 nt2.29□□□□□ -2.04
LCB4Q12246 YHL041WYHL041W 450 nt2.29□□□□□ -2.04
LCB4Q12246 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.29□□□□□ -2.04
LCB4Q12246 AFI1YOR129C 2682 nt2.29□□□□□ -2.04
LCB4Q12246 DFG16YOR030W 1860 nt2.28□□□□□ -2.04
LCB4Q12246 CBF2YGR140W 2871 nt2.28□□□□□ -2.04
LCB4Q12246 SNF5YBR289W 2718 nt2.28□□□□□ -2.04
LCB4Q12246 IRA2YOL081W 9240 nt2.28□□□□□ -2.04
LCB4Q12246 UBP15YMR304W 3693 nt2.28□□□□□ -2.04
LCB4Q12246 NUP120YKL057C 3114 nt2.28□□□□□ -2.04
LCB4Q12246 SMY2YBR172C 2223 nt2.28□□□□□ -2.04
LCB4Q12246 SGM1YJR134C 2124 nt2.28□□□□□ -2.04
LCB4Q12246 ATP7YKL016C 525 nt2.28□□□□□ -2.04
LCB4Q12246 YBR224WYBR224W 516 nt2.28□□□□□ -2.04
LCB4Q12246 VMA9YCL005W-A 222 nt2.28□□□□□ -2.04
LCB4Q12246 SIR3YLR442C 2937 nt2.28□□□□□ -2.04
LCB4Q12246 ALK2YBL009W 2031 nt2.28□□□□□ -2.04
LCB4Q12246 RIC1YLR039C 3171 nt2.28□□□□□ -2.04
LCB4Q12246 SMY1YKL079W 1971 nt2.27□□□□□ -2.05
LCB4Q12246 YEL043WYEL043W 2871 nt2.27□□□□□ -2.05
LCB4Q12246 YNL018CYNL018C 1839 nt2.27□□□□□ -2.05
LCB4Q12246 BRP1YGL007W 378 nt2.27□□□□□ -2.05
LCB4Q12246 YIL059CYIL059C 366 nt2.27□□□□□ -2.05
LCB4Q12246 HTB2YBL002W 396 nt2.27□□□□□ -2.05
LCB4Q12246 SAR1YPL218W 573 nt2.27□□□□□ -2.05
LCB4Q12246 ACM1YPL267W 630 nt2.27□□□□□ -2.05
LCB4Q12246 GIS1YDR096W 2685 nt2.27□□□□□ -2.05
LCB4Q12246 YFR016CYFR016C 3702 nt2.27□□□□□ -2.05
LCB4Q12246 TFC3YAL001C 3483 nt2.26□□□□□ -2.05
LCB4Q12246 YDR048CYDR048C 315 nt2.26□□□□□ -2.05
LCB4Q12246 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt2.26□□□□□ -2.05
LCB4Q12246 UTP22YGR090W 3714 nt2.26□□□□□ -2.05
LCB4Q12246 YBR184WYBR184W 1572 nt2.26□□□□□ -2.05
LCB4Q12246 CRM1YGR218W 3255 nt2.26□□□□□ -2.05
LCB4Q12246 YKU80YMR106C 1890 nt2.26□□□□□ -2.05
LCB4Q12246 UFD4YKL010C 4452 nt2.26□□□□□ -2.05
LCB4Q12246 OST1YJL002C 1431 nt2.25□□□□□ -2.05
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