Protein–RNA interactions for Protein: Q12010

YPQ1, Probable vacuolar amino acid transporter YPQ1, yeastyeast

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPQ1Q12010 HSH155YMR288W 2916 nt1.86□□□□□ -2.11
YPQ1Q12010 MCD1YDL003W 1701 nt1.86□□□□□ -2.11
YPQ1Q12010 SCH9YHR205W 2475 nt1.85□□□□□ -2.11
YPQ1Q12010 TOR2YKL203C 7425 nt1.85□□□□□ -2.11
YPQ1Q12010 SWT1YOR166C 1377 nt1.85□□□□□ -2.11
YPQ1Q12010 YER137W-AYER137W-A 306 nt1.85□□□□□ -2.11
YPQ1Q12010 HIT1YJR055W 495 nt1.85□□□□□ -2.11
YPQ1Q12010 YLR031WYLR031W 561 nt1.85□□□□□ -2.11
YPQ1Q12010 YLR287CYLR287C 1068 nt1.85□□□□□ -2.11
YPQ1Q12010 LSM7YNL147W 348 nt1.85□□□□□ -2.11
YPQ1Q12010 YPL185WYPL185W 396 nt1.85□□□□□ -2.11
YPQ1Q12010 COS111YBR203W 2775 nt1.85□□□□□ -2.11
YPQ1Q12010 GRR1YJR090C 3456 nt1.85□□□□□ -2.11
YPQ1Q12010 IRC20YLR247C 4671 nt1.84□□□□□ -2.11
YPQ1Q12010 NEO1YIL048W 3456 nt1.84□□□□□ -2.11
YPQ1Q12010 VPS52YDR484W 1926 nt1.84□□□□□ -2.11
YPQ1Q12010 CDC50YCR094W 1176 nt1.84□□□□□ -2.11
YPQ1Q12010 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt1.84□□□□□ -2.11
YPQ1Q12010 YOR333CYOR333C 417 nt1.84□□□□□ -2.11
YPQ1Q12010 BRO1YPL084W 2535 nt1.84□□□□□ -2.12
YPQ1Q12010 TDA9YML081W 3756 nt1.84□□□□□ -2.12
YPQ1Q12010 MNE1YOR350C 1992 nt1.83□□□□□ -2.12
YPQ1Q12010 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt1.83□□□□□ -2.12
YPQ1Q12010 SNC1YAL030W 354 nt1.83□□□□□ -2.12
YPQ1Q12010 YMR324CYMR324C 243 nt1.83□□□□□ -2.12
YPQ1Q12010 NOP14YDL148C 2433 nt1.83□□□□□ -2.12
YPQ1Q12010 MPH1YIR002C 2982 nt1.83□□□□□ -2.12
YPQ1Q12010 TRL1YJL087C 2484 nt1.82□□□□□ -2.12
YPQ1Q12010 YDL041WYDL041W 354 nt1.82□□□□□ -2.12
YPQ1Q12010 ATP17YDR377W 306 nt1.82□□□□□ -2.12
YPQ1Q12010 YER023C-AYER023C-A 213 nt1.82□□□□□ -2.12
YPQ1Q12010 RPS20YHL015W 366 nt1.82□□□□□ -2.12
YPQ1Q12010 FKS1YLR342W 5631 nt1.82□□□□□ -2.12
YPQ1Q12010 COX1Q0045 1605 nt1.81□□□□□ -2.12
YPQ1Q12010 RRP12YPL012W 3687 nt1.81□□□□□ -2.12
YPQ1Q12010 YDL068WYDL068W 330 nt1.81□□□□□ -2.12
YPQ1Q12010 RPL27BYDR471W 411 nt1.81□□□□□ -2.12
YPQ1Q12010 NOP10YHR072W-A 177 nt1.81□□□□□ -2.12
YPQ1Q12010 SPO22YIL073C 2928 nt1.8□□□□□ -2.12
YPQ1Q12010 TRM3YDL112W 4311 nt1.8□□□□□ -2.12
YPQ1Q12010 SMD1YGR074W 441 nt1.8□□□□□ -2.12
YPQ1Q12010 URM1YIL008W 300 nt1.8□□□□□ -2.12
YPQ1Q12010 YLR053CYLR053C 327 nt1.8□□□□□ -2.12
YPQ1Q12010 PDR8YLR266C 2106 nt1.8□□□□□ -2.12
YPQ1Q12010 YML003WYML003W 873 nt1.8□□□□□ -2.12
YPQ1Q12010 YML009C-AYML009C-A 327 nt1.8□□□□□ -2.12
YPQ1Q12010 YOR146WYOR146W 306 nt1.8□□□□□ -2.12
YPQ1Q12010 DIE2YGR227W 1578 nt1.8□□□□□ -2.12
YPQ1Q12010 YDR286CYDR286C 345 nt1.79□□□□□ -2.12
YPQ1Q12010 RTT102YGR275W 474 nt1.79□□□□□ -2.12
YPQ1Q12010 YHL037CYHL037C 402 nt1.79□□□□□ -2.12
YPQ1Q12010 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt1.79□□□□□ -2.12
YPQ1Q12010 YBL071CYBL071C 309 nt1.79□□□□□ -2.12
YPQ1Q12010 YPL225WYPL225W 441 nt1.79□□□□□ -2.12
YPQ1Q12010 YPR197CYPR197C 564 nt1.79□□□□□ -2.12
YPQ1Q12010 IRC10YOL015W 1761 nt1.79□□□□□ -2.12
YPQ1Q12010 CDC24YAL041W 2565 nt1.79□□□□□ -2.12
YPQ1Q12010 USO1YDL058W 5373 nt1.79□□□□□ -2.12
YPQ1Q12010 CFT2YLR115W 2580 nt1.78□□□□□ -2.12
YPQ1Q12010 BFA1YJR053W 1725 nt1.78□□□□□ -2.12
YPQ1Q12010 GRX8YLR364W 330 nt1.78□□□□□ -2.12
YPQ1Q12010 YOR121CYOR121C 306 nt1.78□□□□□ -2.12
YPQ1Q12010 YPL238CYPL238C 390 nt1.78□□□□□ -2.12
YPQ1Q12010 ROX1YPR065W 1107 nt1.78□□□□□ -2.12
YPQ1Q12010 SFB2YNL049C 2631 nt1.78□□□□□ -2.12
YPQ1Q12010 snR79snR79 84 nt1.77□□□□□ -2.13
YPQ1Q12010 VOA1YGR106C 798 nt1.77□□□□□ -2.13
YPQ1Q12010 TMA22YJR014W 597 nt1.77□□□□□ -2.13
YPQ1Q12010 CGI121YML036W 546 nt1.77□□□□□ -2.13
YPQ1Q12010 CAT2YML042W 2013 nt1.77□□□□□ -2.13
YPQ1Q12010 CRM1YGR218W 3255 nt1.77□□□□□ -2.13
YPQ1Q12010 CDC60YPL160W 3273 nt1.76□□□□□ -2.13
YPQ1Q12010 GNT1YOR320C 1476 nt1.76□□□□□ -2.13
YPQ1Q12010 VPS34YLR240W 2628 nt1.76□□□□□ -2.13
YPQ1Q12010 ELG1YOR144C 2376 nt1.76□□□□□ -2.13
YPQ1Q12010 YDL118WYDL118W 381 nt1.76□□□□□ -2.13
YPQ1Q12010 WIP1YDR374W-A 270 nt1.76□□□□□ -2.13
YPQ1Q12010 LSO2YGR169C-A 279 nt1.76□□□□□ -2.13
YPQ1Q12010 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt1.76□□□□□ -2.13
YPQ1Q12010 HER1YOR227W 3741 nt1.76□□□□□ -2.13
YPQ1Q12010 ADR1YDR216W 3972 nt1.75□□□□□ -2.13
YPQ1Q12010 LYS9YNR050C 1341 nt1.75□□□□□ -2.13
YPQ1Q12010 CTF4YPR135W 2784 nt1.75□□□□□ -2.13
YPQ1Q12010 YER076W-AYER076W-A 348 nt1.75□□□□□ -2.13
YPQ1Q12010 YER121WYER121W 345 nt1.75□□□□□ -2.13
YPQ1Q12010 HOP2YGL033W 657 nt1.75□□□□□ -2.13
YPQ1Q12010 YGR035CYGR035C 351 nt1.75□□□□□ -2.13
YPQ1Q12010 RPA34YJL148W 702 nt1.75□□□□□ -2.13
YPQ1Q12010 MRPL31YKL138C 396 nt1.75□□□□□ -2.13
YPQ1Q12010 COA6YMR244C-A 315 nt1.75□□□□□ -2.13
YPQ1Q12010 RTC6YPL183W-A 282 nt1.75□□□□□ -2.13
YPQ1Q12010 UBP2YOR124C 3819 nt1.75□□□□□ -2.13
YPQ1Q12010 YSW1YBR148W 1830 nt1.75□□□□□ -2.13
YPQ1Q12010 CFT1YDR301W 4074 nt1.75□□□□□ -2.13
YPQ1Q12010 SYH1YPL105C 2550 nt1.74□□□□□ -2.13
YPQ1Q12010 GCN2YDR283C 4980 nt1.74□□□□□ -2.13
YPQ1Q12010 RBK1YCR036W 1002 nt1.74□□□□□ -2.13
YPQ1Q12010 RPL37BYDR500C 267 nt1.74□□□□□ -2.13
YPQ1Q12010 YNL010WYNL010W 726 nt1.74□□□□□ -2.13
YPQ1Q12010 YPR146CYPR146C 330 nt1.74□□□□□ -2.13
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