Protein–RNA interactions for Protein: Q04228

UBX2, UBX domain-containing protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBX2Q04228 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.64□□□□□ -2.15
UBX2Q04228 RPC10YHR143W-A 213 nt1.64□□□□□ -2.15
UBX2Q04228 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt1.64□□□□□ -2.15
UBX2Q04228 YKL044WYKL044W 321 nt1.64□□□□□ -2.15
UBX2Q04228 SEC22YLR268W 645 nt1.64□□□□□ -2.15
UBX2Q04228 SPC29YPL124W 762 nt1.64□□□□□ -2.15
UBX2Q04228 FYV8YGR196C 2454 nt1.63□□□□□ -2.15
UBX2Q04228 SPR3YGR059W 1539 nt1.63□□□□□ -2.15
UBX2Q04228 SMB1YER029C 591 nt1.63□□□□□ -2.15
UBX2Q04228 CIC1YHR052W 1131 nt1.63□□□□□ -2.15
UBX2Q04228 SEN15YMR059W 387 nt1.63□□□□□ -2.15
UBX2Q04228 SVS1YPL163C 783 nt1.63□□□□□ -2.15
UBX2Q04228 KAR3YPR141C 2190 nt1.63□□□□□ -2.15
UBX2Q04228 VPS52YDR484W 1926 nt1.63□□□□□ -2.15
UBX2Q04228 NOT5YPR072W 1683 nt1.63□□□□□ -2.15
UBX2Q04228 PAU3YCR104W 375 nt1.62□□□□□ -2.15
UBX2Q04228 MET32YDR253C 576 nt1.62□□□□□ -2.15
UBX2Q04228 YER121WYER121W 345 nt1.62□□□□□ -2.15
UBX2Q04228 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.62□□□□□ -2.15
UBX2Q04228 GIC1YHR061C 945 nt1.62□□□□□ -2.15
UBX2Q04228 YJR079WYJR079W 330 nt1.62□□□□□ -2.15
UBX2Q04228 TRX1YLR043C 312 nt1.62□□□□□ -2.15
UBX2Q04228 PKR1YMR123W 369 nt1.62□□□□□ -2.15
UBX2Q04228 SAR1YPL218W 573 nt1.62□□□□□ -2.15
UBX2Q04228 IRC16YPR038W 360 nt1.62□□□□□ -2.15
UBX2Q04228 GPX2YBR244W 489 nt1.62□□□□□ -2.15
UBX2Q04228 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt1.62□□□□□ -2.15
UBX2Q04228 SPO75YLL005C 2607 nt1.62□□□□□ -2.15
UBX2Q04228 TBS1YBR150C 3285 nt1.61□□□□□ -2.15
UBX2Q04228 MON2YNL297C 4911 nt1.61□□□□□ -2.15
UBX2Q04228 CMC2YBL059C-A 330 nt1.61□□□□□ -2.15
UBX2Q04228 MNL2YLR057W 2550 nt1.61□□□□□ -2.15
UBX2Q04228 HIR3YJR140C 4947 nt1.61□□□□□ -2.15
UBX2Q04228 UBP3YER151C 2739 nt1.6□□□□□ -2.15
UBX2Q04228 SGD1YLR336C 2700 nt1.6□□□□□ -2.15
UBX2Q04228 Q0144Q0144 330 nt1.6□□□□□ -2.15
UBX2Q04228 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt1.6□□□□□ -2.15
UBX2Q04228 YBL083CYBL083C 426 nt1.6□□□□□ -2.15
UBX2Q04228 YBR071WYBR071W 636 nt1.6□□□□□ -2.15
UBX2Q04228 YBR224WYBR224W 516 nt1.6□□□□□ -2.15
UBX2Q04228 snR79snR79 84 nt1.59□□□□□ -2.15
UBX2Q04228 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt1.59□□□□□ -2.15
UBX2Q04228 STE18YJR086W 333 nt1.59□□□□□ -2.15
UBX2Q04228 SEC63YOR254C 1992 nt1.59□□□□□ -2.16
UBX2Q04228 TRM732YMR259C 4263 nt1.59□□□□□ -2.16
UBX2Q04228 YLR149CYLR149C 2193 nt1.58□□□□□ -2.16
UBX2Q04228 TFC8YPL007C 1767 nt1.58□□□□□ -2.16
UBX2Q04228 YER188C-AYER188C-A 300 nt1.58□□□□□ -2.16
UBX2Q04228 POL5YEL055C 3069 nt1.57□□□□□ -2.16
UBX2Q04228 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt1.57□□□□□ -2.16
UBX2Q04228 RPL31AYDL075W 342 nt1.57□□□□□ -2.16
UBX2Q04228 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.57□□□□□ -2.16
UBX2Q04228 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.57□□□□□ -2.16
UBX2Q04228 NOP15YNL110C 663 nt1.57□□□□□ -2.16
UBX2Q04228 SWT1YOR166C 1377 nt1.57□□□□□ -2.16
UBX2Q04228 ZRG8YER033C 3231 nt1.57□□□□□ -2.16
UBX2Q04228 SNF5YBR289W 2718 nt1.56□□□□□ -2.16
UBX2Q04228 DAS1YJL149W 1992 nt1.56□□□□□ -2.16
UBX2Q04228 PPN1YDR452W 2025 nt1.56□□□□□ -2.16
UBX2Q04228 APQ13YJL075C 417 nt1.56□□□□□ -2.16
UBX2Q04228 EAF6YJR082C 342 nt1.56□□□□□ -2.16
UBX2Q04228 CTK3YML112W 891 nt1.56□□□□□ -2.16
UBX2Q04228 PET123YOR158W 957 nt1.56□□□□□ -2.16
UBX2Q04228 SLM6YBR266C 453 nt1.56□□□□□ -2.16
UBX2Q04228 NUP120YKL057C 3114 nt1.55□□□□□ -2.16
UBX2Q04228 MSS11YMR164C 2277 nt1.55□□□□□ -2.16
UBX2Q04228 TIF11YMR260C 462 nt1.55□□□□□ -2.16
UBX2Q04228 GPI15YNL038W 690 nt1.55□□□□□ -2.16
UBX2Q04228 PGA1YNL158W 597 nt1.55□□□□□ -2.16
UBX2Q04228 ASM4YDL088C 1587 nt1.55□□□□□ -2.16
UBX2Q04228 PEP3YLR148W 2757 nt1.54□□□□□ -2.16
UBX2Q04228 ADR1YDR216W 3972 nt1.54□□□□□ -2.16
UBX2Q04228 MAD1YGL086W 2250 nt1.54□□□□□ -2.16
UBX2Q04228 YCR043CYCR043C 384 nt1.54□□□□□ -2.16
UBX2Q04228 IES5YER092W 378 nt1.54□□□□□ -2.16
UBX2Q04228 RPL9AYGL147C 576 nt1.54□□□□□ -2.16
UBX2Q04228 YAP3YHL009C 993 nt1.54□□□□□ -2.16
UBX2Q04228 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt1.54□□□□□ -2.16
UBX2Q04228 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt1.54□□□□□ -2.16
UBX2Q04228 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt1.54□□□□□ -2.16
UBX2Q04228 SMY1YKL079W 1971 nt1.54□□□□□ -2.16
UBX2Q04228 DDR48YMR173W 1293 nt1.53□□□□□ -2.16
UBX2Q04228 IRE1YHR079C 3348 nt1.53□□□□□ -2.17
UBX2Q04228 KCS1YDR017C 3153 nt1.52□□□□□ -2.17
UBX2Q04228 PAC1YOR269W 1485 nt1.52□□□□□ -2.17
UBX2Q04228 SHE9YDR393W 1371 nt1.52□□□□□ -2.17
UBX2Q04228 LOA1YPR139C 903 nt1.52□□□□□ -2.17
UBX2Q04228 YPR146CYPR146C 330 nt1.52□□□□□ -2.17
UBX2Q04228 SPC110YDR356W 2835 nt1.51□□□□□ -2.17
UBX2Q04228 YGR250CYGR250C 2346 nt1.51□□□□□ -2.17
UBX2Q04228 YSW1YBR148W 1830 nt1.5□□□□□ -2.17
UBX2Q04228 YER088C-AYER088C-A 324 nt1.5□□□□□ -2.17
UBX2Q04228 CRG1YHR209W 876 nt1.5□□□□□ -2.17
UBX2Q04228 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt1.5□□□□□ -2.17
UBX2Q04228 YOR029WYOR029W 336 nt1.5□□□□□ -2.17
UBX2Q04228 YPR039WYPR039W 336 nt1.5□□□□□ -2.17
UBX2Q04228 YBR184WYBR184W 1572 nt1.5□□□□□ -2.17
UBX2Q04228 MSC6YOR354C 2079 nt1.49□□□□□ -2.17
UBX2Q04228 CGI121YML036W 546 nt1.49□□□□□ -2.17
UBX2Q04228 PBI2YNL015W 228 nt1.49□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 102.6 ms