Protein–RNA interactions for Protein: Q02199

NUP49, Nucleoporin NUP49/NSP49, yeastyeast

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NUP49Q02199 URA10YMR271C 684 nt1.14□□□□□ -2.23
NUP49Q02199 RCN2YOR220W 798 nt1.14□□□□□ -2.23
NUP49Q02199 EST2YLR318W 2655 nt1.14□□□□□ -2.23
NUP49Q02199 ZRG8YER033C 3231 nt1.14□□□□□ -2.23
NUP49Q02199 RIC1YLR039C 3171 nt1.14□□□□□ -2.23
NUP49Q02199 DOT6YER088C 2013 nt1.13□□□□□ -2.23
NUP49Q02199 snR84snR84 550 nt1.13□□□□□ -2.23
NUP49Q02199 BNA7YDR428C 786 nt1.13□□□□□ -2.23
NUP49Q02199 YER175W-AYER175W-A 165 nt1.13□□□□□ -2.23
NUP49Q02199 YJR141WYJR141W 1044 nt1.13□□□□□ -2.23
NUP49Q02199 TIF11YMR260C 462 nt1.13□□□□□ -2.23
NUP49Q02199 YNL010WYNL010W 726 nt1.13□□□□□ -2.23
NUP49Q02199 RPB11YOL005C 363 nt1.13□□□□□ -2.23
NUP49Q02199 SNC2YOR327C 348 nt1.13□□□□□ -2.23
NUP49Q02199 RTC6YPL183W-A 282 nt1.13□□□□□ -2.23
NUP49Q02199 DAS1YJL149W 1992 nt1.13□□□□□ -2.23
NUP49Q02199 SNU56YDR240C 1479 nt1.12□□□□□ -2.23
NUP49Q02199 ALK1YGL021W 2283 nt1.12□□□□□ -2.23
NUP49Q02199 HNT1YDL125C 477 nt1.12□□□□□ -2.23
NUP49Q02199 MTC7YEL033W 420 nt1.12□□□□□ -2.23
NUP49Q02199 ILM1YJR118C 612 nt1.12□□□□□ -2.23
NUP49Q02199 RRT15YLR162W-A 189 nt1.12□□□□□ -2.23
NUP49Q02199 UTP13YLR222C 2454 nt1.12□□□□□ -2.23
NUP49Q02199 VOA1YGR106C 798 nt1.11□□□□□ -2.23
NUP49Q02199 TIM10YHR005C-A 282 nt1.11□□□□□ -2.23
NUP49Q02199 YJL022WYJL022W 309 nt1.11□□□□□ -2.23
NUP49Q02199 IRC19YLL033W 693 nt1.11□□□□□ -2.23
NUP49Q02199 CMS1YLR003C 876 nt1.11□□□□□ -2.23
NUP49Q02199 BER1YLR412W 825 nt1.11□□□□□ -2.23
NUP49Q02199 PHO80YOL001W 882 nt1.11□□□□□ -2.23
NUP49Q02199 EGD1YPL037C 474 nt1.11□□□□□ -2.23
NUP49Q02199 YPL197CYPL197C 414 nt1.11□□□□□ -2.23
NUP49Q02199 YBR071WYBR071W 636 nt1.11□□□□□ -2.23
NUP49Q02199 ROX1YPR065W 1107 nt1.11□□□□□ -2.23
NUP49Q02199 MDM32YOR147W 1869 nt1.11□□□□□ -2.23
NUP49Q02199 NUP82YJL061W 2142 nt1.1□□□□□ -2.23
NUP49Q02199 YGR250CYGR250C 2346 nt1.1□□□□□ -2.23
NUP49Q02199 STE18YJR086W 333 nt1.1□□□□□ -2.23
NUP49Q02199 YBL083CYBL083C 426 nt1.1□□□□□ -2.23
NUP49Q02199 MSC6YOR354C 2079 nt1.1□□□□□ -2.23
NUP49Q02199 NOT5YPR072W 1683 nt1.1□□□□□ -2.23
NUP49Q02199 MSH3YCR092C 3057 nt1.09□□□□□ -2.23
NUP49Q02199 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.09□□□□□ -2.23
NUP49Q02199 MDS3YGL197W 4464 nt1.09□□□□□ -2.23
NUP49Q02199 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt1.09□□□□□ -2.23
NUP49Q02199 YDL068WYDL068W 330 nt1.09□□□□□ -2.23
NUP49Q02199 RTR2YDR066C 591 nt1.09□□□□□ -2.23
NUP49Q02199 YER088C-AYER088C-A 324 nt1.09□□□□□ -2.23
NUP49Q02199 ANS1YHR126C 480 nt1.09□□□□□ -2.23
NUP49Q02199 APQ13YJL075C 417 nt1.09□□□□□ -2.23
NUP49Q02199 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt1.09□□□□□ -2.23
NUP49Q02199 YKL044WYKL044W 321 nt1.09□□□□□ -2.23
NUP49Q02199 YKL111CYKL111C 336 nt1.09□□□□□ -2.23
NUP49Q02199 YMR324CYMR324C 243 nt1.09□□□□□ -2.23
NUP49Q02199 PGA1YNL158W 597 nt1.09□□□□□ -2.23
NUP49Q02199 IRC16YPR038W 360 nt1.09□□□□□ -2.23
NUP49Q02199 YSY6YBR162W-A 198 nt1.09□□□□□ -2.23
NUP49Q02199 MET32YDR253C 576 nt1.08□□□□□ -2.24
NUP49Q02199 LSO2YGR169C-A 279 nt1.08□□□□□ -2.24
NUP49Q02199 SPC1YJR010C-A 285 nt1.08□□□□□ -2.24
NUP49Q02199 FCF2YLR051C 654 nt1.08□□□□□ -2.24
NUP49Q02199 COX7YMR256C 183 nt1.08□□□□□ -2.24
NUP49Q02199 SVS1YPL163C 783 nt1.08□□□□□ -2.24
NUP49Q02199 KAP122YGL016W 3246 nt1.08□□□□□ -2.24
NUP49Q02199 SPR3YGR059W 1539 nt1.07□□□□□ -2.24
NUP49Q02199 YCR043CYCR043C 384 nt1.07□□□□□ -2.24
NUP49Q02199 SMB1YER029C 591 nt1.07□□□□□ -2.24
NUP49Q02199 RPC10YHR143W-A 213 nt1.07□□□□□ -2.24
NUP49Q02199 YJR079WYJR079W 330 nt1.07□□□□□ -2.24
NUP49Q02199 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt1.07□□□□□ -2.24
NUP49Q02199 COF1YLL050C 432 nt1.07□□□□□ -2.24
NUP49Q02199 PKR1YMR123W 369 nt1.07□□□□□ -2.24
NUP49Q02199 GAL7YBR018C 1101 nt1.07□□□□□ -2.24
NUP49Q02199 MNL2YLR057W 2550 nt1.07□□□□□ -2.24
NUP49Q02199 LAA1YJL207C 6045 nt1.06□□□□□ -2.24
NUP49Q02199 AZF1YOR113W 2745 nt1.06□□□□□ -2.24
NUP49Q02199 YLR149CYLR149C 2193 nt1.06□□□□□ -2.24
NUP49Q02199 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt1.06□□□□□ -2.24
NUP49Q02199 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt1.06□□□□□ -2.24
NUP49Q02199 GPI15YNL038W 690 nt1.06□□□□□ -2.24
NUP49Q02199 YBR224WYBR224W 516 nt1.06□□□□□ -2.24
NUP49Q02199 GPX2YBR244W 489 nt1.06□□□□□ -2.24
NUP49Q02199 MSN5YDR335W 3675 nt1.06□□□□□ -2.24
NUP49Q02199 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt1.06□□□□□ -2.24
NUP49Q02199 VPS52YDR484W 1926 nt1.05□□□□□ -2.24
NUP49Q02199 YGR290WYGR290W 444 nt1.05□□□□□ -2.24
NUP49Q02199 VPS55YJR044C 423 nt1.05□□□□□ -2.24
NUP49Q02199 EAF6YJR082C 342 nt1.05□□□□□ -2.24
NUP49Q02199 LCL2YLR104W 396 nt1.05□□□□□ -2.24
NUP49Q02199 SEC22YLR268W 645 nt1.05□□□□□ -2.24
NUP49Q02199 DDR48YMR173W 1293 nt1.05□□□□□ -2.24
NUP49Q02199 LOA1YPR139C 903 nt1.05□□□□□ -2.24
NUP49Q02199 RLM1YPL089C 2031 nt1.05□□□□□ -2.24
NUP49Q02199 KAR3YPR141C 2190 nt1.04□□□□□ -2.24
NUP49Q02199 snR79snR79 84 nt1.04□□□□□ -2.24
NUP49Q02199 RPL9AYGL147C 576 nt1.04□□□□□ -2.24
NUP49Q02199 CTK3YML112W 891 nt1.04□□□□□ -2.24
NUP49Q02199 NOP15YNL110C 663 nt1.04□□□□□ -2.24
NUP49Q02199 APL1YJR005W 2103 nt1.04□□□□□ -2.24
NUP49Q02199 YLR422WYLR422W 5799 nt1.04□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 29.2 ms