Protein–RNA interactions for Protein: Q01196

RUNX1, Runt-related transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1Q01196 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RUNX1Q01196 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RUNX1Q01196 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms