Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CRIP3Q6Q6R5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms